核受体亚科 1,H 组,成员 5,伪基因;NR1H5P
法尼酯 X-激活受体,β,假基因;FXRB
HGNC 批准的基因符号:NR1H5P
细胞遗传学定位:1p13.2 基因组坐标(GRCh38):1:111,200,001-115,500,000
▼ 说明
在人类和灵长类动物中,NR1H5P 是假基因。然而,在其他哺乳动物中,它编码一种功能性核激素受体,似乎参与胆固醇生物合成(Otte et al., 2003)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析,Otte et al.(2003)鉴定出了人类NR1H5P,他们将其称为FXRB。他们发现人类 FXRB 包含多个终止密码子和移码。RT-PCR 显示人 FXRB 的表达极低,表明它是一个假基因。在灵长类动物中也发现了类似的结果。然而,在所有其他哺乳动物中,Fxrb 包含一个连续的 ORF,表明它编码一种功能蛋白。RT-PCR和RACE揭示了小鼠Fxrb的几种剪接变体,包括编码505个氨基酸的蛋白质的全长变体,该蛋白质含有保守的DNA结合结构域和保守的配体结合结构域。RT-PCR 显示小鼠胚胎发育过程中普遍存在且强烈的表达。在成年小鼠中,Fxrb 表达更具组织特异性,主要限于肝脏、生殖组织和心脏。与Fxr(NR1H4)共表达;603826)在肝脏和肠道中观察到,但在肾脏中未观察到。
▼ 基因功能
Otte et al.(2003)发现,小鼠Fxrb与Rxra(180245)异二聚化,并通过特定的DNA反应元件刺激转录。作者确定羊毛甾醇是 Fxrb 的候选内源配体,可诱导 Fxrb 的共激活子招募和转录激活。Otte et al.(2003)得出结论,Fxrb是非灵长类动物中控制胆固醇生物合成的功能性受体。
▼ 基因结构
Otte et al.(2003)确定人类NR1H5P含有11个外显子。NR1H5P 在外显子 11 处有 2 个终止密码子,在外显子-内含子连接处有 3 个移码,表明它可能是一个无功能的假基因。
▼ 测绘
Gross(2017)根据NR1H5P序列(GenBank NG_007471)与基因组序列(GRCh38)的比对,将NR1H5P假基因对应到染色体1p13.2。