死框解旋酶 54;DDX54
死亡/H框54
死框 RNA 解旋酶,97-KD;DP97
HGNC 批准的基因符号:DDX54
细胞遗传学定位:12q24.13 基因组坐标(GRCh38):12:113,157,173-113,185,478(来自 NCBI)
▼ 说明
DEAD box 家族成员(包括 DDX54)是假定的 ATP 依赖性 RNA 解旋酶,在细胞发育、分化和增殖等多种细胞过程中发挥重要作用。该基因家族的名称来源于氨基酸序列Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD),是该家族成员共有的至少8个高度保守的基序之一。另见DDX8(600396)。
▼ 克隆与表达
使用抗雌激素配体的ER-α(ESR1;)通过酵母2-杂交筛选人乳腺癌细胞 133430)作为诱饵,然后通过筛选人类肌肉cDNA文库,Rajendran等人(2003)克隆了DDX54,他们将其称为DP97。推导的 865 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 97 kD。DDX54包含2个二分核定位信号、3个核受体框(LXXLL基序)、一个潜在的CoRNR框以及几段谷氨酸和赖氨酸残基。Northern 印迹分析在几种人类癌细胞系和所有检查的组织中检测到一个 3.1-kb 转录物和一个较小的 4.3-kb 转录物,其中在胰腺和肺中表达最高。免疫细胞化学研究将 DDX54 定位于细胞核,分布于整个核质并集中在核仁处。DDX54 与 ER-α 共定位于核质中的斑点结构。
▼ 测绘
Stumpf(2020)根据DDX54序列(GenBank BC005848.2)与基因组序列(GRCh38)的比对,将DDX54基因定位到染色体12q24.13。
▼ 基因功能
Rajendran et al.(2003)表明DDX54表现出ATP依赖性RNA解旋酶活性。体外结合和酵母 2-杂交分析表明,抗雌激素配体 ER-α 的相互作用比雌二醇配体 ER-α 更强。在转染DDX54的中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中,反式激活实验表明DDX54抑制ER-α转录活性,并且DDX54还表现出针对ER-β(ESR2;ESR2;601663)、黄体酮(PGR;607311)、糖皮质激素(GCCR;138040)、RARA(180240)。缺失研究和Gal4融合研究表明,DDX54氨基酸589-631起到转录抑制结构域的作用,并且C端DDX54氨基酸664-865与核受体的C端部分相互作用。DDX54 的反义和 siRNA 敲低均导致 ER 转录活性和雌二醇刺激基因表达增加。
▼ 分子遗传学
Paine等人(2019)报告了3个无血缘关系的个体在DDX54基因中存在纯合或复合杂合突变。第一个患者(10号)是一名23岁女性,婴儿期出现发育迟缓,3岁时出现癫痫发作,后来缓解,5岁时出现右侧肌张力障碍和手部震颤。脑部MRI显示异常双侧大脑脚、丘脑和脑室周围白质的信号。她的 2 个顺式错义突变是杂合的:L286F(该突变在患者中从头发生,但存在于父亲等位基因上)和 N216S(遗传自她的父亲)。L286F变种在gnomAD数据库中不存在,N216S变种的频率为4.0 x 10(-6)。第二名患者(11 号)患有发育迟缓/智力发育受损和松果体囊肿。她是2个错义突变的复合杂合子:W20R和R611G,这两个错义突变在gnomAD中的出现频率分别为6.5 x 10(-5)和3.0 x 10(-5)。第三名患者(12 号)表现为双侧多囊性发育不良肾脏。她是V286M 变体的纯合子,该变体在gnomAD 中的频率为8.9 x 10(-4)。