神经母细胞瘤断点家族,成员 15;NBPF15
MGC8902
神经母细胞瘤断点家族,成员 16;NBPF16
HGNC 批准的基因符号:NBPF15
细胞遗传学定位:1q21.1 基因组坐标(GRCh38):1:144,421,390-144,461,669(来自 NCBI)
▼ 说明
NBPF15 是 NBPF 基因家族的成员,该家族由 22 个基因和由基因复制产生的假基因组成。NBPF基因含有大量低拷贝重复元件,在编码区和非编码区表现出高度的基因间和基因内序列同一性(Vandepoele et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
Vandepoele et al.(2005)通过在EST数据库中搜索与NBPF1(610501)相似的序列,鉴定出NBPF15。
Popesco等人(2006)预测MGC8902基因编码6个拷贝的DUF1220结构域,每个拷贝约65个氨基酸长。
▼ 基因结构
Vandepoele et al.(2005)确定NBPF15基因包含15个编码外显子,其中2个由内部重复产生。
▼ 测绘
Vandepoele et al.(2005)通过基因组序列分析和FISH,将NBPF15基因定位到染色体1q21.1上的NBPF基因簇。
▼ 进化
65 个氨基酸的 DUF1220 结构域出现在许多蛋白质中(Popesco et al., 2006)。编码这些结构域的序列实际上都是灵长类动物特有的,显示出正选择的迹象,并且随着物种与人类的进化接近性而逐渐扩增,其中发现了最大数量的拷贝(212)。它在黑猩猩中出现了 37 次,在猕猴中出现了 30 次,在小鼠和大鼠基因组中出现了一次。DUF1220 结构域在与较高认知功能相关的人脑区域中高度表达,并且在大脑中优先在细胞体和树突中显示神经元特异性表达。