驱动蛋白家族成员12;KIF12
HGNC 批准基因符号:KIF12
细胞遗传学定位:9q32 基因组坐标(GRCh38):9:114,091,638-114,099,292(来自 NCBI)
KIF12 是微管相关分子马达驱动蛋白超家族的成员(参见 148760),在细胞内运输和细胞分裂中发挥重要作用(Nakakawa et al., 1997)。
▼ 克隆与表达
Nakakawa等(1997)以简并驱动蛋白超家族序列引物为探针,对4周龄小鼠肾cDNA进行PCR筛选,克隆了小鼠Kif12。Katoh和Katoh(2005)通过使用小鼠Kif12作为探针进行数据库分析,组装了全长人类KIF12。推导的 651 个氨基酸蛋白包含一个驱动蛋白运动催化结构域、一个具有内部铰链区的卷曲螺旋结构域和一个 C 端尾部结构域。KIF12 与其小鼠同源物有 80.8% 的氨基酸序列同一性。EST 数据库分析确定了 KIF12 在胎儿肝脏、成人大脑和胰岛以及肾肿瘤、子宫癌和胰腺癌中的表达。
▼ 基因结构
Katoh and Katoh(2005)确定KIF12基因含有19个外显子。
▼ 测绘
Katoh and Katoh(2005)通过基因组序列分析,将KIF12基因定位到染色体9q32。
▼ 分子遗传学
Unlusoy Aksu et al.(2019)在3名来自无关近亲家庭的PFIC8患者(包括一对同胞)中发现了KIF12基因的纯合突变(611278.0001;611278.0002)。这些突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。未进行功能研究。所有 3 名患者均出现胆汁淤积且 GGT 升高。
Maddirevula等人(2019)在来自3个近亲家庭的4名PFIC8患者中鉴定出KIF12基因纯合突变(611278.0002-611278.0004)。3个家族的自合性作图显示染色体9上有重叠区域,但具有不同的单倍型,表明不存在共同的创始人突变。这些突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。
Stalke等(2021)在来自3个无关近亲PFIC家族(A、B、C家族)的5例PFIC8患者中,发现KIF12基因存在相同的纯合突变(611278.0001)。患者肝组织的免疫荧光染色显示 KIF12 的细胞质表达发生改变。Stalke et al.(2021)也用顶膜转运蛋白 BSEP(ABCB11; 603201)和MRP2(ABCC2;601107),基底外侧转运蛋白OATP1B1(SLCO1B1; 604843)、紧密连接蛋白ZO1(TJP1; 601009)以确定KIF12突变对肝细胞极性的影响。虽然 BSEP、OAT1B1 和 ZO1 定位是适当的,但 MRP2 表现出强烈的细胞质信号,表明 MRP2 运输可能受到损害,并表明 KIF12 突变导致细胞极性部分受损。
▼ 等位基因变异体(4个精选例子):
.0001 胆汁淤积,进行性家族性肝内胆汁淤积,8
KIF12、ARG219TER
一名 22 个月大的女孩,由叙利亚近亲婚生,患有进行性家族性肝内胆汁淤积-8(PFIC8;619662),Unlusoy Aksu et al.(2019)鉴定了 KIF12 基因中 c.655C-T 转换(c.655C-T, NM_138424)的纯合性,导致 arg219-to-ter(R219X)取代。该突变经全外显子组测序鉴定并经桑格测序证实,在父母双方中均呈杂合状态。该突变在NHLBI和千人基因组计划数据库中不存在,但在ExAC数据库中以1.73 x10(-5)的等位基因频率存在,在gnomAD数据库中以3.233 x 10(-5)的等位基因频率存在。未进行功能研究。
Stalke等人(2021)在来自3个无血缘关系的近亲家族(A、B、C家族)的5名PFIC8患者中,鉴定出KIF12基因外显子8中R219X突变的纯合性。这些突变是通过全外显子组测序鉴定的,并根据每个家族的疾病进行分类。其中一名患者肝组织中 KIF12 mRNA 的表达与正常对照相似。患者肝组织的免疫荧光染色显示 KIF12 的细胞质表达发生改变,表明 mRNA 并未发生衰减,并且突变导致截短蛋白的表达发生改变。
.0002 胆汁淤积,进行性家族性肝内胆汁淤积,8
KIF12、VAL204MET
2 名同胞,由近亲土耳其父母所生,患有进行性家族性肝内胆汁淤积-8(PFIC8;619662),Unlusoy Aksu et al.(2019)鉴定了KIF12基因中c.610G-A转换(c.610G-A,NM_138424)的纯合性,导致val204-to-met(V204M)取代。该突变经全外显子组鉴定并经桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该突变在NHLBI数据库中不存在,在ExAC数据库中的等位基因频率为0f 2.58 x 10(-5),在gnomAD数据库中的等位基因频率为2.092 x 10(-5)。未进行功能研究。
Maddirevula et al.(2019)在具有 PFIC8 的近亲家族(家族 3)的 2 名成员中鉴定出 KIF12 基因中 V204M 突变的纯合性。该突变通过自合性作图和全外显子组测序的结合鉴定,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该突变不存在于 2,379 个种族匹配的外显子组中,但存在于 gnomAD 数据库中,等位基因频率为 0.00002093。
.0003 胆汁淤积,进行性家族性肝内胆汁淤积,8
KIF12、ARG155TER
男孩(家庭1),近亲所生,患有进行性家族性肝内胆汁淤积-8(PFIC8;619662),Maddirevula et al.(2019)在KIF12基因中发现了一个纯合的c.463C-T转换(c.463C-T, NM_138424.1),导致arg155到ter(R155X)的取代。该突变通过自合性作图和全外显子组测序的结合鉴定,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该突变不存在于 gnomAD 数据库或 2,379 个种族匹配的外显子组中。
.0004 胆汁淤积,进行性家族性肝内胆汁淤积,8
KIF12、ARG219GLN
近亲结婚男孩,患有进行性家族性肝内胆汁淤积-8(PFIC8;619662),Maddirevula et al.(2019)在KIF12基因中发现了一个纯合的c.656G-A转换(c.656G-A, NM_138424.1),导致arg219到gln(R219Q)的取代。该突变通过自合性作图和全外显子组测序的结合鉴定,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该突变不存在于 gnomAD 数据库或 2,379 个种族匹配的外显子组中。