宏 H2A.2 组蛋白; MACROH2A2
H2A 组蛋白家族,成员 Y2;H2AFY2
MACRO H2A2
HGNC 批准的基因符号:MACROH2A2
细胞遗传学定位:10q22.1 基因组坐标(GRCh38):10:70,052,846-70,112,282(来自 NCBI)
▼ 说明
H2AFY2 是 H2A 家族的核心组蛋白变体,还包含一个大的非组蛋白区域。它与不活跃的 X 染色体有关,并在生殖效率中发挥作用(Pehrson et al., 2014)。
有关组蛋白、组蛋白基因簇和 H2A 组蛋白家族的背景信息,请参阅 HIST1H2AA(613499)。
▼ 克隆与表达
通过数据库检索macroH2A1(H2AFY;610054),Costanzi 和 Pehrson(2001)鉴定出了人类 H2AFY2,他们将其称为 MacroH2A2。预测的 371 个氨基酸蛋白与 H2AFY 的 MacroH2A1.2 变体有 68% 的同一性。MacroH2A2 包含一个 N 端 H2A 区域,与人类 H2A 具有 66% 的同一性,随后是一个独特的碱性区域和一个长的非组蛋白区域,其中包括一个假定的亮氨酸拉链。小鼠肝脏的免疫荧光显微镜检查显示,与macroH2a1.2相比,macroH2a2在实质、导管上皮和导管周围区域中有强表达,但在肝细胞中没有表达。老鼠肾脏和肾上腺组织的染色也显示出macroH2a2和macroH2a1.2的不同表达模式。在小鼠肾中,macroH2a2在近曲小管和Bowman囊壁层中表现出强表达。在小鼠肾上腺中,macroH2a2 染色主要出现在被膜的外细胞中。MacroH2A1.2 和 MacroH2A2 也具有相似但不相同的核分布,两者共定位于不活跃的 X 染色体。
Chadwick 和 Willard(2001)孤立地鉴定了小鼠和人类 MacroH2A2。预测的小鼠和人 MacroH2A2 蛋白含有 372 个氨基酸,计算出的分子量为 40.1 kD。它们具有 98% 的氨基酸同一性。EST 数据库分析表明 H2AFY2 普遍表达。免疫印迹分析显示转染的 HEK293 细胞的核小体中表达约 44 kD 的蛋白质。免疫荧光显微镜证明 MacroH2A2 和 MacroH2A1.2 的共定位仅限于巴尔小体。
▼ 基因结构
Chadwick和Willard(2001)以及Costanzi和Pehrson(2001)孤立地确定H2AFY2基因包含9个外显子,其中第一个是非编码外显子。
▼ 测绘
Chadwick and Willard(2001)通过基因组序列分析,将H2AFY2基因定位到染色体10q22.3。
▼ 动物模型
Pehrson et al.(2014)发现macroH2a2敲除小鼠没有明显的发育或生殖问题。然而,同时缺乏macroH2a1和macroH2a2的小鼠表现出产前和产后生长受损,并且繁殖效率显着降低。对缺乏macroH2a1和/或macroH2a2的小鼠的胎儿和成年肝脏进行的微阵列研究表明,macroH2A组蛋白对基因表达产生很大的积极或消极影响,其中macroH2a1和macroH2a2对某些基因的表达具有协同作用,但对另一些基因的表达则相反。在成人肝脏中,影响优先涉及与脂质代谢相关的基因,包括瘦素受体(LEPR;601007)。禁食强烈影响 MacroH2A 依赖性基因调控。Pehrson et al.(2014)提出macroH2A组蛋白会对基因表达产生适应性变化,特别是涉及肝脏的代谢。