锌指蛋白 382;ZNF382

KRAB/锌指抑制蛋白 1,大鼠,同源物;KS1

HGNC 批准的基因符号:ZNF382

细胞遗传学定位:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:36,605,313-36,634,114(来自 NCBI)

▼ 说明

C2H2锌指转录因子家族的成员,例如ZNF382,在响应多种刺激的细胞增殖、分化和凋亡的调节中发挥关键作用(Gebelein等,1998)。

▼ 克隆与表达

Gebelein等人(1998)克隆了大鼠Znf382,他们将其命名为Ks1。Northern 印迹分析检测到 Ks1 普遍表达,在肺、肾和睾丸中表达水平最高。转染人胰腺细胞系后,免疫荧光定位检测到细胞核中带有表位标记的 Ks1。

Luo等(2002)通过使用设计用于扩增KRAB结构域编码序列的PCR引物筛选胎心cDNA文库,然后进行EST数据库分析和胎心RNA的RACE,克隆了ZNF382。推导的 548 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 64 kD。ZNF382 包含 N 端 KRAB A 和 KRAB B 结构域,随后是一个残留的锌指、一个核定位信号,以及位于其 C 端的 9 个串联重复的 Kruppel 型 C2H2-锌指结构域。ZNF382 与大鼠 Ks1 在 KRAB 和锌指结构域中分别具有 91% 和 83% 的氨基酸同一性。Northern 印迹分析检测到在心脏中大量表达的 2.9-kb 转录物。在骨骼肌中检测到较弱的表达,但在其他 6 个检查的组织中未检测到表达。ZNF382 的表达在人类胎儿组织中更为广泛。整个 34 天和 40 天的胚胎显示出高 ZNF382 表达。在发育后期,ZNF382 主要在小脑、肾脏和大脑中检测到,其次在肺、心脏、骨骼肌、舌头和肾上腺中检测到。

▼ 基因功能

Gebelein等(1998)通过生化分析确定大鼠Ks1含有2个转录抑制结构域,R1和R2。R1 对应于 KRAB A 基序,R2 紧接在 KRAB B 基序之后。小鼠成纤维细胞系中大鼠 Ks1 的表达抑制了 Hras(190020)和其他强癌基因介导的肿瘤转化。缺失分析表明R2 是抑制转化所必需的。

Gebelein 和 Urrutia(2001)利用随机寡核苷酸结合分析鉴定了一个 27 bp 的大鼠 Ks1 结合元件(KBE)。删除和定点突变揭示了 Ks1 的 9 个 C 末端锌指和 KRAB 结构域是通过 KBE 位点进行转录抑制所必需的。Ks1的KRAB结构域与KAP1(TRIM28;601742)辅阻遏物,并且消除这种相互作用的突变减轻了 Ks1 介导的转录抑制。

Ma等(2021)利用原位杂交发现小鼠周围神经损伤后背根神经节(DRG)神经元中Znf382表达下调。受损 DRG 中 Znf382 的下调是神经性疼痛发生和维持所必需的,并且足以诱发神经性疼痛。Znf382抑制DRG神经元中Cxcl13(605149)的转录,因此,需要下调Znf382来增加Cxcl13及其受体Cxcr5(601613)的表达,从而诱导神经性疼痛症状。作者在 Cxcl13 转录起始位点上游发现了一个基因间 Znf382 结合区域,该区域充当 Cxcl13 的转录沉默子,并且是 Znf382 触发的 Cxcl13 抑制和神经性疼痛缓解所必需的。为了调节Cxcl13转录,Znf382与Hdac1(601241)和Setdb1(604396)形成复合物,以确定DRG神经元中Cxcl13启动子的表观遗传修饰。然而,在受损的 DRG 神经元中,Znf382 复合物的形成减少。进一步分析表明,Znf382 调节 DRG 中 Cxcl13 表观遗传修饰需要 Cxcl13 沉默子,因为沉默子与 Cxcl13 启动子形成环,充当支架。

▼ 基因结构

Luo等(2002)确定ZNF382基因包含5个外显子,跨度约23 kb。

▼ 测绘

Luo等(2002)通过基因组序列分析,将ZNF382基因定位到染色体19q13.13。

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