锌指 RANBP2 型域包含蛋白 3;ZRANB3

锌指 RAN 结合结构域蛋白 3

HGNC 批准的基因符号:ZRANB3

细胞遗传学定位:2q21.3 基因组坐标(GRCh38):2:135,196,969-135,531,218(来自 NCBI)

▼ 说明

ZRANB3 属于 DNA 依赖性 ATP 酶的 SNF2(参见 600014)家族,其在复制应激反应中发挥作用并催化停滞复制叉的重塑(​​Badu-Nkansah 等人,2016)。

▼ 克隆与表达

Weston等人(2012)从HeLa细胞cDNA文库中克隆了ZRANB3。推导的 1,079 个氨基酸的蛋白质具有预测的 N 端 ATP 依赖性解旋酶结构域,随后是 PCNA(176740)相互作用蛋白(PIP)框基序、NZF 型锌指和 C 端 HNH 型核酸内切酶结构域。荧光标记的 ZRANB3 定位于转染的 U2OS 细胞的核灶。

▼ 基因功能

Weston et al.(2012)发现表位标记的ZRANB3与内源性PCNA和MCM主要复制DNA解旋酶的几个子单元(例如MCM3;602693)在转染的293T细胞中。荧光标记的 ZRANB3 被招募到 DNA 损伤位点,并与 PCNA 共定位于受损的复制叉处。通过短发夹 RNA 敲低 ZRANB3 使 293T 细胞对烷化剂甲基磺酸盐诱导的 DNA 损伤敏感,但对其他类型的 DNA 损伤剂不敏感。结构域分析表明,ZRANB3 的 N 端解旋酶结构域具有 DNA 依赖性 ATP 酶活性,PIP 框结合 PCNA,NZF 基序结合 lys63 多聚泛素链,C 端 HNH 结构域结合分支 DNA 底物,包括那些模仿DNA复制中间体。纯化的表位标记 ZRANB3 将展开的 DNA 双链体转化为含有 5 素单链突出端的 DNA 双链体产物。Weston et al.(2012)得出结论,DNA损伤后PCNA的多泛素化将ZRANB3招募到停滞的复制叉,并且ZRANB3在修复复制相关的DNA损伤中发挥作用。

Badu-Nkansah et al.(2016)发现人ZRANB3分离的N端ATPase结构域失活。他们在氨基酸 720 至 869 之间发现了一个结构识别域(SRD),该结构域结合分支 DNA 底物,并且是激活 DNA 依赖性 ATP 酶活性所必需的。SRD 也是叉重塑和结构特异性核酸内切酶活性所必需的。SRD 通过柔性接头与 ATPase 结构域融合,具有与全长 ZRANB3 类似的分叉重塑活性。

▼ 测绘

Hartz(2016)根据ZRANB3序列(GenBank AL136824)与基因组序列(GRCh38)的比对,将ZRANB3基因定位到染色体2q21.3。

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