末端分化诱导的非编码 RNA; TINCR

组织分化诱导非编码 RNA

HGNC 批准的基因符号：TINCR

细胞遗传学定位：19p13.3 基因组坐标（GRCh38）：19:5,558,167-5,567,953（来自 NCBI）

▼ 说明

TINCR 是一种分化诱导的、主要是细胞质的长非编码 RNA（lncRNA），是发育后体细胞分化所必需的（Kretz et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

通过对祖细胞和分化人类角质形成细胞进行转录组测序，Kretz et al.（2013）发现，TINCR，一种未表征的lncRNA，是258个注释的ncRNA中诱导程度最高的lncRNA之一。

▼ 测绘

Kretz et al.（2013）发现人类TINCR基因位于SAFB2（608066）和ZNRF4（612063）基因之间的染色体19p13.3上，该位点在染色体17qD上具有同线性非编码区。

▼ 基因结构

TINCR基因包含3个外显子（Kretz et al., 2013）。

▼ 基因功能

Kretz et al.（2013）确定TINCR产生一个3.7-kb的转录本，在表皮分化过程中被诱导超过150倍。TINCR 在人类鳞状细胞癌标本中表达下调，与鳞状细胞癌中观察到的分化程度降低一致。Kretz等人（2013）利用单分子RNA FISH鉴定了细胞质内分化过程中新获得的TINCR分子的80.6%。人表皮中的 FISH 显示分化层中 TINCR 富集。Kretz et al.（2013）发现TINCR是表皮分化关键蛋白介质正常诱导所必需的。Kretz et al.（2013）表明TINCR通过转录后机制控制人类表皮分化。TINCR是关键分化基因高mRNA丰度所必需的，其中许多基因在人类皮肤病中发生突变，包括FLG（135940）和LOR（152445）。TINCR缺陷的表皮缺乏终末分化超微结构，包括透明角质颗粒和完整的板层体。基因组规模的 RNA 相互作用组分析表明，TINCR 与一系列分化 mRNA 相互作用。TINCR-mRNA 相互作用通过 25 个核苷酸的“TINCR 框”基序发生，该基序在相互作用的 mRNA 中非常丰富，并且是 TINCR 结合所必需的。分析 TINCR 与大约 9,400 种人类重组蛋白的结合能力的高通量筛选揭示了 TINCR RNA 与 staufen-1（STAU1；601716）蛋白质。STAU1 缺陷组织再现了 TINCR 耗尽时所见的分化受损。STAU1介导的RNA衰变所需的UPF1（601430）和UPF2（605529）的缺失，却没有分化效应。相反，TINCR-STAU1复合物似乎介导分化mRNA的稳定，例如KRT80（611161）。Kretz et al.（2013）得出的结论是，他们的数据将TINCR确定为体细胞组织分化所需的关键lncRNA，这是通过lncRNA与分化mRNA结合以确保其表达而发生的。