口颌面裂 12; OFC12
伴有或不伴有腭裂的唇裂,非综合征性,12
细胞遗传学定位:8q24.3 基因组坐标(GRCh38):8:138,900,001-145,138,636
有关非综合征 CL/P 的表型描述和遗传异质性的讨论,请参阅 119530。
▼ 测绘
Birnbaum et al.(2009)进行了一项全基因组关联研究,涉及 224 名中欧血统的非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(NSCL/P)的无关患者,并在染色体 8q24.21 上鉴定出一个 640 kb 的区域,其中包含 3 个标记,达到全基因组显着性。对462例无关的NSCL/P病例中640-kb区域的精细定位发现了与该疾病显着相关的SNP(rs987525)(p = 3.34 x 10(-24);优势比(杂合子为 2.57,纯合子为 6.05)。计算得出的该标志物的人群归因风险为 0.41,表明这代表了 NSCL/P 的主要易感位点。
在爱沙尼亚和立陶宛的孤立样本中,Nikopensius等(2009)重复了之前报道的rs987525与非综合征性口裂之间的关联,在两组中都获得了高度显着的结果(p = 5.97 x 10(-5)和p = 1.6 x 10( -5),分别)。杂合基因型的优势比分别为1.58和1.89,纯合基因型的优势比分别为5.56和11.13。爱沙尼亚人和立陶宛人的风险等位基因频率约为 16%,低于先前报道的德国对照样本中约 20% 的频率(Birnbaum 等,2009)。
Ludwig 等人(2012)利用当时发表的两项最大的全基因组关联研究的数据对 NSCL/P 进行了首次荟萃分析。最高风险与染色体8q24上基因组位置129.77-130.30的SNP rs987525的A等位基因相关(荟萃分析p值= 5.12 x 10(-35))。杂合子相对风险为1.919(95% CI, 1.660-2.218);纯合状态的相对风险为4.384(95% CI, 3.393-5.666)。
▼ 细胞遗传学
Alkuraya et al.(2006)报道了一名患有单侧非综合征性唇腭裂的5岁女孩,其染色体2q33.1和8q24.3之间存在平衡易位。在2q断点处SUMO1基因(601912)被中断;Alkuraya et al.(2006)提出SUMO1单倍体不足导致CL/P(参见OFC10, 601912)。