硬脂酰辅酶A去饱和酶5;SCD5

酰基辅酶A去饱和酶4;ACOD4

HGNC 批准的基因符号:SCD5

细胞遗传学定位:4q21.22 基因组坐标(GRCh38):4:82,629,539-82,798,796(来自 NCBI)

▼ 说明

硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD; EC 1.14.99.5)是内质网的整合膜蛋白,催化饱和脂肪酸形成单不饱和脂肪酸。SCD 可能是能量代谢的关键调节因子,在肥胖和血脂异常中发挥作用。四种 SCD 亚型(Scd1 到 Scd4)已在小鼠中鉴定出。相比之下,在人类中仅发现了 2 种 SCD 亚型:SCD1(604031)和 SCD5。SCD1 与所有 4 个小鼠 SCD 亚型以及大鼠 Scd1 和 Scd2 具有约 85% 的氨基酸同一性。相比之下,SCD5 与啮齿动物 SCD 的同源性有限,并且似乎是灵长类动物所独有的(Wang et al., 2005)。

▼ 克隆与表达

Beiraghi等人(2003)通过分析染色体4中涉及与唇裂家族性病例相关的平衡中心周倒位的区域(见608371),克隆了SCD5,并将其命名为ACOD4。推导的 330 个氨基酸蛋白质的预测分子量为 37.6 kD。与其他 SCD 一样,SCD5 包含一个独特的 N 末端,后跟一个 5 次跨膜区域和 3 个催化组氨酸框,这些组氨酸框被认为可以结合酶活性所需的非血红素铁。Northern 印迹分析检测到 3.0-kb 转录物在胎儿大脑中高水平表达,而在胎儿肾脏中低水平表达。在胎儿肺或任何检查的成人组织中均未检测到 SCD5 表达。

Lu等(2020)通过对豚鼠耳蜗连续切片进行免疫组织化学分析,观察到血管纹、螺旋突后的耳蜗外侧壁细胞以及耳蜗器官的内毛细胞和外毛细胞中表达。 Corti,在螺旋神经节细胞的细胞质中表达最强。在人胎儿耳蜗中,SCD5 在螺旋神经节细胞和柯蒂氏器中表达。

▼ 基因结构

Beiraghi et al.(2003)确定SCD5基因包含5个外显子,长度约为169 kb。

▼ 测绘

Beiraghi等(2003)通过FISH和基因组序列分析,将SCD5基因定位到染色体4q21.1。

▼ 分子遗传学

在一个大型 5 代中国家庭中,将常染色体显性遗传非综合征进行性感觉神经性听力损失对应到染色体 4(DFNA79; Lu et al.(2020)发现SCD5基因杂合错义突变(W209S; 619086)608370.0001)与疾病分离,在对照中未发现。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 耳聋,常染色体显性遗传 79(1 个家族)

SCD5、TRP209SER

在一个5代中国大家庭(家族60)中,将常染色体显性遗传非综合征性进行性感觉神经性听力损失对应到染色体4(DFNA79; 619086),Lu et al.(2020)在SCD5基因的外显子2中发现了c.626G-C颠换(c.626G-C, NM_001037582)的杂合性,导致trp209到ser(W209S)的取代第三跨膜结构域内高度保守的残基。该突变随疾病而分离,在 100 名对照者或 81 名散发性听力损失患者中未发现;然而,在 1000 Genomes 和 ExAC 数据库中发现其次要等位基因频率较低(分别为 0.0002 和 0.00008)。对转染的 HEI-OC1 细胞的分析显示,与野生型 SCD5 相比,W209S 突变体的细胞增殖率较低。

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