小卡哈尔体特异性 RNA 8; SCARNA8
snoRNA, U92
HGNC 批准的基因符号:SCARNA8
细胞遗传学定位:9p22.1 基因组坐标(GRCh38):9:19,063,656-19,063,786(来自 NCBI)
▼ 说明
小核仁 RNA(snoRNA),如 SCARNA8,充当指导 RNA 转录后修饰的向导。含有与纤维蛋白相关的C/D框的SnoRNA(FBL; 134795)和剪接体小核RNA(snRNA)的直接2-prime-O-核糖甲基化,而含有H/ACA框的那些与GAR1(NOLA1; 134795)相关。606468)和snRNA的直接假尿苷化。SCARNA8 包含一个 H/ACA 框,预计可以指导 snRNA 的假尿苷化(Darzacq et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Darzacq 等人(2002)在人类 GAR1 相关 snoRNA 的 cDNA 文库中鉴定了 SCARNA8,他们将其命名为 U92。预计 131 个核苷酸的 RNA 会折叠成框 H/ACA snoRNA 的共有发夹-铰链-发夹-尾结构。在HeLa细胞中过表达后,荧光原位杂交和细胞分级分离显示U92与线圈蛋白(COIL; 600272),卡哈尔身体标记。
▼ 基因功能
Darzacq等人(2002)通过对HeLa细胞进行免疫沉淀分析,发现人U92与GAR1相互作用,但不与fibrillarin相互作用。
▼ 测绘
Hartz(2014)根据SCARNA8序列(GenBank AY077742)与基因组序列(GRCh37)的比对,将SCARNA8基因定位到染色体9p22.1。