核因子-KAPPA-B 抑制剂样蛋白 1;NFKBIL1

NFKB 抑制剂样蛋白 1
B细胞KAPPA轻链基因增强子核因子抑制剂样1
B 细胞样 KAPPA 轻链基因增强子的抑制剂;IKBL
核因子 KAPPA-B 抑制剂样

HGNC 批准的基因符号:NFKBIL1

细胞遗传学定位:6p21.33 基因组坐标(GRCh38):6:31,546,851-31,558,829(来自 NCBI)

▼ 说明

NFKB1(164011)或NFKB2(164012)与REL(164910)、RELA(164014)或RELB(604758)结合形成NFKB复合体。NFKB 复合物被 I-kappa-B 蛋白(NFKBIA, 164008 或 NFKBIB, 604495)抑制,通过将 NF-kappa-B 捕获在细胞质中使其失活。I-kappa-B 蛋白上的丝氨酸残基被激酶(IKBKA, 600664 或 IKBKB, 603258)磷酸化,标记它们通过泛素化途径被破坏,从而激活 NF-kappa-B 复合物。激活的 NFKB 复合物易位到细胞核中,并在 kappa-B 结合基序处结合 DNA,例如 5-prime GGGRNNYYCC 3-prime 或 5-prime HGGARNYYCC 3-prime(其中 H 是 A、C 或 T;R是A或G嘌呤;Y为C或T嘧啶)。

▼ 克隆与表达

Albertella和Campbell(1994)在BAT1(142560)与6p21上的TNFB(153440)和TNFA(191160)簇之间的人类主要组织相容性复合物中鉴定出一个基因,他们将其命名为IKBL(I-kappa-B-like)。 3. 从 U937 前单核细胞白血病细胞系文库中分离出 cDNA,预计编码 381 个氨基酸的蛋白质。该蛋白含有与 I-kappa-B(164008)蛋白家族类似的锚蛋白基序。该基因跨越 13.5 kb 的基因组 DNA,其 3 引物末端距 TNFB 5 引物末端约 12 kb。Northern 印迹分析在多种细胞类型中检测到 1.6 kb mRNA,包括单核细胞、T 细胞、B 细胞和肝细胞。

▼ 分子遗传学

Okamoto et al.(2003)在NFKBIL1基因启动子区(601022.0001)鉴定出代表第二类风湿性关节炎(RA;RA;180300)HLA区域内的易感位点,第一个是HLA-DRB1(142857)。RA敏感等位基因-62T周围的核苷酸序列是转录因子δ-EF1(TCF8;189909)(Allcock 等,2001)。对 41 个 δ-EF 结合位点的检查表明,该位点均包含 T 等位基因(Sekido 等,1994)。相反,不敏感的等位基因 -62A 可能会破坏 δ-EF1 的这个基序。

有关 NFKBIL1 基因变异与无深静脉血栓的慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)之间可能关联的讨论,请参阅 612862。

▼ 进化

Allcock 等人(1999)对源自特征明确且保守的祖先单倍型中的中央 MHC 基因的 RT-PCR 产物进行了测序。他们发现 IKBL 基因位于中央 MHC 端粒末端的 TNF 簇附近,在大多数祖先单倍型之间是保守的。然而,观察到一些变化。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 类风湿性关节炎,易感性

NFKBIL1,-62T-A

Okamoto et al.(2003)鉴定出一个类风湿性关节炎非HLA-DRB1(142857)主要组织相容性复合体染色体连锁易感性等位基因(180300):NFKBIL1基因-62T/A SNP的T等位基因。

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