介导复合体子单元 13; MED13

甲状腺激素受体相关蛋白 1;THRAP1
甲状腺激素受体相关蛋白,240-KD; TRAP240

HGNC 批准的基因符号:MED13

细胞遗传学定位:17q23.2 基因组坐标(GRCh38):17:61,942,605-62,065,278(来自 NCBI)

▼ 说明

MED13 是大型介体复合物的一个子单元,与 DNA 结合转录因子和 RNA 聚合酶 II(参见 180660)一起发挥作用以实现基因激活(Sato 等人总结,2004)。

▼ 克隆与表达

Ito 等人(1999)使用 HeLa 细胞系克隆了 TRAP240,该基因编码 TRAP 复合物的 240-kD 子单元。TRAP240 cDNA 编码一个 2,174 个氨基酸的蛋白质,与假设的线虫蛋白(CEK08F8 和 CEF07H5)显示出 29% 的区域同一性和 46% 的相似性。除了1188-1192和1279-1283位上的2个配体依赖性核激素受体特征识别基序(LXXLL序列)以及1331-1352位上的一个短亮氨酸拉链外,它与已知的共有序列没有明显的关系。对多个人体组织的 Northern 印迹分析表明,TRAP240 基因以大约 11.5 kb 的转录本形式普遍表达。Nagase等人(1998)也从人脑cDNA文库中克隆了编码TRAP240的cDNA,他们将其称为KIAA0593。

▼ 基因功能

Sato等人(2004)利用HeLa细胞中的多种蛋白纯化方法证实MED13(TRAP240)是Mediator复合物的一个组成部分。

▼ 测绘

通过对人类-啮齿动物杂交组的分析,Nagase等人(1998)将MED13基因定位到染色体17。

Stumpf(2020)根据MED13序列(GenBank BC140891.1)与基因组序列(GRCh38)的比对,将MED13基因定位到染色体17q23.2。

▼ 分子遗传学

11名无血缘关系的患者和一对患有常染色体显性智力发育障碍-61(MRD61;MRD61;618009),Snijders Blok 等人(2018)鉴定了 MED13 基因中的杂合突变(参见例如 603808.0001-603808.0005)。这些患者是通过合作研究工作和 GeneMatcher 项目确定的。这些突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中不存在。11 名患者体内发生了新的突变;1 是从受影响的母亲遗传的。有 3 个无义变体、2 个移码变体和 6 个错义变体,以及 1 个单个残基的框内缺失。对携带 R1400X 突变(603808.0004)的患者的细胞进行分析,结果显示 MED13 转录物和蛋白质水平正常,未检测到截短的蛋白质产物。与野生型相比,突变体转录物的检测水平约为 70%。没有对其他变体和其他患者细胞进行额外的功能研究。Snijders Blok 等人(2018)指出,编码介导复合体子单元的其他基因的突变与神经发育障碍相关,这支持了 MED13 变体可能导致这种表型的假设。

▼ 等位基因变异体(5个精选例子):

.0001 智力发育障碍,常染色体显性遗传 61

MED13、LEU131TER

一对患有常染色体显性遗传性智力发育障碍-61(MRD61;MRD61;Snijders Blok et al.(2018)在MED13基因中鉴定出杂合的c.392T-G颠换(c.392T-G, NM_005112.2),导致leu131-to-ter(L131X)取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0002 智力发育障碍,常染色体显性遗传 61

MED13、THR326ILE

一名19岁男性(患者D)患有常染色体显性智力发育障碍-61(MRD61;Snijders Blok et al.(2018)在MED13基因中鉴定出一个从头杂合的c.977C-T转换(977C-T, NM_005112.2),导致thr326到ile(T326I)的替换N 端结构域中的保守残基。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0003 智力发育障碍,常染色体显性遗传 61

MED13, LEU582TER

一名患有常染色体显性遗传性智力发育障碍-61(MRD61;Snijders Blok et al.(2018)在MED13基因中鉴定出一个从头杂合的c.1745T-A颠换(c.1745T-A, NM_005112.2),导致leu582-to-ter(L582X)取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0004 智力发育障碍,常染色体显性遗传 61

MED13、ARG1400TER

一名13岁女孩(患者J)患有常染色体显性智力发育障碍-61(MRD61;618009),Snijders Blok et al.(2018)在MED13基因中鉴定出一个从头杂合的c.4198C-T转换(c.4198C-T, NM_005112.2),导致arg1400到ter(R1400X)的取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。对患者细胞的分析显示 MED13 转录物和蛋白质水平正常,未检测到截短的蛋白质产物。与野生型相比,突变体转录物的检测水平约为 70%。

.0005 智力发育障碍,常染色体显性遗传 61

MED13,1-BP DEL,4487C

一名患有常染色体显性遗传性智力发育障碍-61(MRD61;MRD61;618009),Snijders Blok et al.(2018)在MED13基因中发现了一个从头杂合的1-bp缺失(c.4487delC, NM_005112.2),导致移码和提前终止(Thr1496Metfs)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在 gnomAD 数据库中不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

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