RAS 相关蛋白 RAB6A;RAB6A

RAS 相关蛋白 RAB6;RAB6

HGNC 批准的基因符号:RAB6A

细胞遗传学定位:11q13.4 基因组坐标(GRCh38):11:73,675,638-73,761,074(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

哺乳动物 RAB 蛋白与酿酒酵母 YPT1 和 SEC4 蛋白具有惊人的相似性,这些蛋白是参与分泌调节的 Ras 相关 GTP 结合蛋白。Zahraoui et al.(1989)分离了编码 RAB6 和其他几种人类 RAB 蛋白的 cDNA。预测的人类RAB6蛋白含有208个氨基酸。Northern 印迹分析显示,RAB6 基因在人成纤维细胞系中表达为 3.6-kb mRNA。

Shan等人(2000)通过用RAB6C(612909)DNA片段筛选人肾cDNA文库,孤立出RAB6A变异体,并将其命名为RAB6C。与之前报道的 RAB6A 亚型相比,由该变体编码的推导的 208 个氨基酸的蛋白质仅存在 3 个氨基酸的差异。

▼ 基因功能

Shan等人(2000)使用定量RT-PCR表明,与亲本MCF7细胞系相比,在MCF7乳腺癌细胞的多重耐药克隆中,他们称为RAB6C的RAB6A变体下调。耐药细胞系中 RAB6A 变体的重新表达恢复了对几种抗癌药物的敏感性。流式细胞术实验表明,对阿霉素的敏感性与表达 RAB6A 变体的细胞中药物积累的增加有关。

Brass et al.(2008)利用大规模小干扰RNA筛选来鉴定人类免疫缺陷病毒(HIV)-1所需的宿主因子(见609423),鉴定出超过250个HIV依赖性因子(HDFs),其中79个与其他组织相比,在免疫组织中的表达显着更高。HDFs RAB6和VPS53(615850)是逆行高尔基体转运蛋白,参与病毒进入。Brass等人(2008)提出,靶向对病毒周期至关重要但对宿主不重要的HDF可以避免由于病毒多样性和逃逸突变而产生的耐药性。

Schlager et al.(2010)利用蛋白质下拉分析发现了小鼠 Bicdr1(BICDL1; 617002)与 Rab6b(615852)的相互作用最强,其次是 Rab6a,与其他测试的 Rab 几乎没有结合。在酵母 2-杂交检测中,包含第二个卷曲螺旋结构域的 Bicdr1 C 末端区域与组成型活性、GTPase 缺陷的 Rab6a 结合,但不与非活性、GDP 锁定的 Rab6a 结合。Bicdr1 在人和猴上皮细胞中的过度表达导致 Bicdr1 与 Rab6 阳性囊泡一起在中心体周围区域积聚。在小鼠海马神经元的早期培养中,Bicdr1以剂量依赖性方式在中心体周围积累Rab6和Npy(162640)阳性分泌小泡,限制顺行分泌运输,并抑制神经突生长。Schlager et al.(2010)得出结论,RAB6和BICDR1在分泌囊泡的逆行运输中发挥作用。

Pusapati et al.(2012)发现人RGP1(615742)和RIC1(610354)孤立地与GDP结合的RAB6A相互作用,但都不能单独作为RAB6A的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)发挥作用。相比之下,RIC1 和 RGP1 的共表达产生了 RIC1-RGP1 复合物,该复合物对 RAB6A 显示出浓度依赖性 GEF 活性,但对其他测试的 RAB 蛋白则没有。人类细胞系中 RIC1 或 RGP1 的缺失会导致 RAB6A 蛋白不稳定,并降低其在高尔基复合体中的丰度,同时阻断 RAB6A 依赖性的 6-磷酸甘露糖受体(IGF2R;IGF2R;147280)从晚期内涵体到高尔基体。

▼ 测绘

Rousseau-Merck et al.(1991)通过原位杂交将RAB6基因归属于染色体2q14-q21。

Hartz(2016)根据RAB6A序列(GenBank AF119836)与基因组序列(GRCh38)的比对,将RAB6A基因定位到染色体11q13.4。

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