微 RNA 125B2; MIR125B2

MIRN125B2
miRNA125B2

HGNC 批准的基因符号:MIR125B2

细胞遗传学定位:21q21.1 基因组坐标(GRCh38):21:16,590,237-16,590,325(来自 NCBI)

▼ 说明

MicroRNA(例如 MIR125B)是小型非编码 RNA,可通过与其靶 mRNA 碱基配对来调节转录后靶基因表达。MIR125B1(610104)和MIR125B2均编码相同成熟MIR125B序列的前体,但前体在成熟MIR125B序列侧翼的序列上有所不同(Lee et al., 2005)。

▼ 克隆与表达

Lee等人(2005)使用针对MIR125B1和MIR125B2环区设计的合成siRNA,确定MIR125B2是他们在人类细胞系中检测到的大多数miR125b的来源。MIR125B2 显示细胞系特异性表达,并且在分化程度更高的细胞中以更高水平表达。

Sonkoly et al.(2007)利用实时定量PCR发现miR125B在人体组织中普遍存在,但表达存在差异。最高表达在前列腺、心脏、子宫颈、脑和膀胱中。

▼ 基因功能

Lee等人(2005)使用针对MIRN125B2环区设计的siRNA,去除了人类前列腺癌和HeLa细胞系的miR125b,发现去除会降低细胞增殖。视黄酸诱导畸胎瘤细胞系中的神经元分化降低了 miR125b 的水平,但假定的 miR125b 靶向基因的水平似乎没有变化。

Ciafre等(2005)利用微阵列分析发现,与正常周围脑组织相比,原发性胶质母细胞瘤中MIR125B2的表达显着上调。

Wu et al.(2006)指出,与完全互补的 siRNA 在其结合位点引导 mRNA 裂解不同,不完全互补的 miRNA 显然是通过抑制转录起始来损害其 mRNA 靶标作为蛋白质合成模板的能力。 。他们发现,miR125b 还通过 RNA 衰变下调了 3-prime UTR 中带有 miRE1 或 miRE2(miRNA 响应元件)的报告基因 mRNA。额外的 miR125b 拷贝会导致 miR125b 介导的 RNA 衰减更快。在小鼠胚胎癌细胞中,当诱导分化为神经元时会产生 miR125b,miR125b 暴露降低了 22 个 mRNA 的丰度。在人胚胎肾细胞中,miR125b降低了LIN28、Ajuba(JUB; 609066)、MKK7(MAP2K7;603014)。在所有情况下,miR125b 与 miRE1 的相互作用通过触发快速聚(A)尾去除而诱导 mRNA 衰减。miR125b 对转录抑制的抑制作用是明显的,并且不需要聚腺苷酸尾。

van Rooij et al.(2006)利用微阵列分析,在2个孤立的心脏肥大小鼠模型中上调的一组miRNA中鉴定出miR125B。Northern 印迹分析显示,特发性终末期衰竭人类心脏中 miR125B 的表达增加。

Laneve et al.(2007)发现视黄酸在人神经母细胞瘤细胞系中上调 MIRN9(参见 611186)、MIRN125A(611191)和 MIRN125B。他们鉴定出编码 t-NTRK3(NTRK3 的截短亚型)的 mRNA(191316)作为 3 个 miRNA 的靶标。t-NTRK3 转录本的 3-prime UTR 有一个 MIRN9 的结合位点,还有一个 MIRN125A 和 MIRN125B 的结合位点,它们共享相同的种子序列。这些 miRNA 以加性方式抑制 t-NTRK3 表达,并且 t-NTRK3 的下调对于调节神经母细胞瘤细胞生长至关重要。与其功能一致,MIRN9、MIRN125A 和 MIRN125B 在原发性神经母细胞瘤中下调。

Sonkoly等人(2007)利用微阵列分析和定量实时PCR发现,与正常人皮肤相比,牛皮癣(见177900)和特应性湿疹(见603165)中miR125B的表达降低。

探讨ATM(607585)杂合突变的功能后果,纯合突变引起共济失调毛细血管扩张(AT; 208900),Smirnov and Cheung(2008)比较了非携带者、AT携带者和AT患者的基因和microRNA表达表型。作者发现,与 AT 患者相比,非携带者和 AT 携带者之间的一些表达表型更加相似,正如隐性遗传疾病所预期的那样。然而,对于某些表达表型,AT 携带者与患者比非携带者更相似。Smirnov and Cheung(2008)对这些表达表型之一TNFSF4(603594)水平的分析,揭示了ATM通过MIRN125B调节TNFSF4表达的调控途径。在 AT 携带者和 AT 患者中,该通路被破坏。因此,与非携带者相比,MIRN125B 的水平较低,而其靶基因 TNFSF4 的水平较高。MIRN125B 水平降低与乳腺癌相关,TNFSF4 水平升高与动脉粥样硬化相关。因此,Smirnov和Cheung(2008)得出结论,他们的发现为AT携带者患乳腺癌和心脏病风险增加提供了机制建议。

Le et al.(2009)在斑马鱼和人p53(TP53; 3-prime UTRs)中鉴定出高度保守的miRNA反应元件。191170)转录本并显示 MIR125B 直接与这些元件结合。MIR125B 抑制内源性 p53 的转录,降低 p53 靶基因的表达,并对抗药物诱导的人类细胞凋亡。斑马鱼胚胎中 mir125b 的敲低会导致严重的发育缺陷,特别是大脑中死亡细胞的积累,而 mir125b 的缺失会增加 p53 蛋白和 p53 依赖性细胞凋亡。用 DNA 损伤剂处理斑马鱼胚胎导致 mir125b 下调和 p53 蛋白快速增加。Le et al.(2009)得出结论,MIR125B是p53和p53在发育和应激反应过程中诱导的细胞凋亡的重要负调节因子。

Sun et al.(2011)发现MIR125B2和所有MIR99家族成员,包括MIR99A(614509)、MIR99B(614510)和MIR100(613186)的表达在C4-2人雄激素非依赖性前列腺癌细胞系中下调。与亲本 LNCaP 雄激素依赖性细胞系相比。与正常前列腺相比,所有 4 个 miRNA 在人前列腺肿瘤组织中也均下调。

Upton et al.(2012)发现持续的IRE1-α(604033)RNase激活导致选择的microRNA(miR17, 609416; miR17, 609416; miR34a,611172;miR96,611606;miR125b)通常会抑制半胱天冬酶-2(600639)mRNA的转录,从而急剧升高线粒体凋亡途径起始蛋白酶的蛋白水平。在无细胞系统中,重组IRE1-α在与DICER(606241)不同的位点对microRNA前体进行核酸内切。因此,Upton et al.(2012)得出结论,IRE1-α通过终止microRNA生物发生来调节促凋亡蛋白,而非编码RNA是内质网(ER)应激反应的一部分。

▼ 测绘

Lee等人(2005)指出,MIRN125B2基因对应到染色体21并且位于基因的内含子内。

Ciafre et al.(2005)指出MIR125B2基因定位于染色体21q11.2,与MIR99A(614509)和LET7C(MIRLET7C)位于一个簇;612144)基因。然而,Gross(2012)根据MIR125B2茎环序列(ACCAGACUUUUCCUAGUCCCUGAGACCCUAACUUGUGAGGUAUUUUAGUAACAUCACAAGUCAGGCUCUUGGGACCUAGGCGGAGGGGA)与基因组序列(GRCh37)的比对,将MIR125B2基因定位到染色体21q21.1。

Emmrich et al.(2014)将MIR99A-MIRLET7C-MIR125B2簇对应到MIR99AHG(615964)的内含子6。

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