精子发生相关蛋白 13; SPATA13

APC 刺激的鸟嘌呤核苷酸交换因子 2; ASEF2

HGNC 批准的基因符号：SPATA13

细胞遗传学定位：13q12.12 基因组坐标（GRCh38）：13:23,979,802-24,307,069（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Hamann et al.（2007）鉴定了 SPATA13 的 3 个剪接变体，他们将其称为 ASEF2。这些变体的5个引物末端不同，所有3个编码蛋白均含有假定的APC（611731）结合区（ABR）、SRC（190090）同源3（SH3）结构域、DBL（MCF2）；311030）同源（DH）结构域，一个直接-白细胞C分裂底物（PLEK; 173570）同源（PH）结构域，以及C端尾部。推导的652个氨基酸的ASEF2蛋白与ASEF1（ARHGEF4；605216）与collybistin（ARHGEF9；605216）同源性为48% 300429）。Northern 印迹分析检测到所有检查组织中至少有 2 个 ASEF2 转录物的可变表达。

Kawasaki et al.（2007）通过数据库分析，鉴定出4个SPATA13剪接变体ASEF2A、ASEF2B、ASEF2C和ASEF2D，分别编码574、652、1,167和1,339个氨基酸的ASEF2亚型。所有 4 种异构体均具有 ABR、SH3、DH 和 PH 结构域，仅 N 端和 C 端序列不同。Northern 印迹分析检测到 8.7 和 6.2 kb 的 ASEF2 转录本。在胎盘、脾脏和肾脏中表达较高，在肺、小肠、肝脏、脑和心脏中表达中等，在骨骼肌中表达较低。RT-PCR 分析检测到结直肠上皮中 ASEF2A 和 ASEF2D 的表达，但未检测到 ASEF2B 和 ASEF2C 的表达。

Waseem 等人（2020）使用 qPCR 分析了 2 个 SPATA13 转录本的表达，他们根据氨基酸长度将其命名为 SP-652 和 SP-1277。在所有 17 种测试的细胞系中均检测到了转录本，包括眼癌、肝癌、肾癌、子宫颈癌、食道癌、纤维肉瘤、乳腺癌、皮肤癌、头颈癌和口腔发育不良。作者还利用qPCR研究了人虹膜、睫状上皮、视网膜色素上皮（RPE）、视网膜、角膜和晶状体中SP-1277和SP-652的mRNA表达。SP-652转录本在角膜和晶状体中表达最高，而SP-1277转录本在角膜和睫状上皮中表达最高，表明SP-1277是原发性闭角型青光眼受影响最严重的组织中的主要转录本（参见分子遗传学））。作者使用 SP-1277 特异性抗体来分析小鼠和人眼切片，观察了色素和非色素睫状上皮、虹膜括约肌和扩张肌、角膜上皮以及视网膜外核、内核和神经节细胞层的反应性。

▼ 基因结构

Hamann et al.（2007）确定SPATA13基因至少含有14个外显子。

▼ 测绘

Hartz（2010）根据SPATA13序列（GenBank AK055770）与基因组序列（GRCh37）的比对，将SPATA13基因定位到染色体13q12.12。

▼ 基因功能

Hamann等人（2007）发现ASEF1和ASEF2都是CDC42（116952）的鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEFs），但不是RAC1（602048）或RHOA（165390）的鸟嘌呤核苷酸交换因子。ASEF2 需要 CDC42 的脂质修饰形式。Hamann等人（2007）利用缺失突变体表明，ASEF蛋白的串联N端ABR和SH3结构域（ABRSH3）需要结合APC的犰狳重复区域。ABRSH3 还通过结合 ASEF1 和 ASEF2 的 C 末端尾部并抑制其 GEF 活性，在自抑制反应中发挥作用。ABRSH3 的缺失或 APC 犰狳重复序列与全长 ASEF2 的共表达刺激了转染的 HeLa 细胞中丝状伪足的形成。Hamann et al.（2007）得出结论，ASEF1和ASEF2的激活涉及APC与ABRSH3的结合，这破坏了ABRSH3与ASEF C末端尾部的自抑制相互作用，并允许CDC42上的GDP/GTP交换。

Kawasaki et al.（2007）表明，ASEF2在HEK293和HeLa细胞中充当CDC42和RAC1的GEF，并且APC增加了其GEF活性。Madin-Darby犬肾（MDCK）细胞中ASEF2的过表达诱导膜皱褶和Rac1介导的板状伪足形成，而HeLa细胞中ASEF2的过表达诱导膜皱褶和CDC42介导的丝状伪足形成。ASEF2 还增加了 MDCK 细胞的细胞运动性。相反，通过短干扰RNA敲低SW480人结肠癌细胞中的ASEF2会降低细胞运动性。免疫沉淀分析证实了ASEF2和APC之间的直接相互作用，突变分析表明ASEF2的ABR和SH3结构域都是相互作用所必需的。Kawasaki et al.（2007）得出结论：ASEF2激活RAC1和CDC42，其活性受APC调节。

Sagara et al.（2009）通过免疫沉淀、质谱和Western blot分析发现ASEF2与Neurabin II（PPP1R9B；PPP1R9B；603325）在人胚胎肾细胞中。HeLa 细胞经 HGF（142409）处理后，ASEF2、Neurabin II 和 APC 积聚并共定位于片状伪足和膜皱褶中。RNA干扰实验表明ASEF2、neurabin II和APC参与HGF诱导的细胞迁移。此外，敲低 Neurabin II 会导致 ASEF2 诱导的丝状伪足形成受到抑制。

▼ 分子遗传学

有关 SPATA13 基因变异与原发性闭角型青光眼之间可能关联的讨论，请参见 GLCC（618880）。