VPS26 内体蛋白分选因子 C;VPS26C
唐氏综合症关键区基因 3;DSCR3
唐氏综合症关键区域基因 A;DSCRA
HGNC 批准基因符号:VPS26C
细胞遗传学定位:21q22.13 基因组坐标(GRCh38):21:37,223,420-37,268,108(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过对 DSCR 重叠群的 GRAIL 分析、搜索 EST 数据库和 RT-PCR,Nakamura 等人(1997)鉴定了编码 DSCR3 的 cDNA,他们将其命名为 DCRA。推导的 297 个氨基酸的 DSCR3 蛋白与小鼠 Dscr3 具有 92% 的一致性。Northern印迹分析在胎儿大脑、心脏、肺、肝脏和肾脏以及成人大脑、心脏、胎盘、肺、肝脏、骨骼肌、肾脏和胰腺中检测到3.3-kb DSCR3转录物;在成人骨骼肌中也检测到了 4 kb 的转录本。
▼ 基因结构
Nakamura et al.(1997)在DCRA基因中检测到8个外显子。
▼ 测绘
Nakamura等人(1997)在染色体21q22.2的唐氏综合症(190685)关键区域内鉴定出DSCR3基因。
Stumpf(2020)根据VPS26C序列(GenBank AK300024)与基因组序列(GRCh38)的比对,将VPS26C基因定位到染色体21q22.13。
▼ 基因功能
McNally 等人(2017)利用人类细胞中的蛋白质组学分析,鉴定了一种进化上保守的多蛋白复合物,由于其结构和功能与逆转录酶复合物相似,他们将其命名为“猎犬”。猎犬复合体是由DSCR3、C16ORF62(VPS35L;618981)、VPS29(606932)。检索器复合物与 COMMD(见 607238)/CCDC22(300859)/CCDC93(CCC)和 WASH(见 613632)复合物相关,并定位于内体,通过与货物偶联来驱动不依赖逆转录酶的检索和大量货物蛋白的回收。因子蛋白SNX17(605963)。
▼ 分子遗传学
有关 VPS26C 基因变异与生长障碍和骨骼异常的神经发育缺陷之间可能关联的讨论,请参阅 605298.0001。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 意义不明的变体
VPS26C、GLU60TER
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对以神经发育缺陷、生长障碍和骨骼异常为特征的综合征的贡献尚未得到证实。
Beetz 等人(2020)通过对来自阿拉伯联合酋长国的一个近亲家庭的 2 位表兄弟进行全基因组测序,他们患有神经发育缺陷、生长障碍和骨骼异常,并且与已知单基因疾病相关的基因突变呈阴性。 VPS26C 基因外显子 2 发生 c.178G-T 颠换(c.178G-T, NM_006052),导致 glu60-to-ter(E60X)取代。该突变在家族中随疾病分离,在 gnomAD 或 CentoMD 数据库中未发现。对先证者杂合父母的分析显示,突变体转录本的丰度约为野生型的40%。突变蛋白的功能分析尚未报道。这对表兄弟,一名 13 岁的男孩和一名 27 岁的女性,都患有多效性疾病,伴有发育迟缓和认知障碍;身材矮小,伴有骨骼异常,包括根茎畸形、短指畸形和关节挛缩;以及独特的面部特征,包括严重的中面部发育不全。