致命物 细胞凝集素样受体,亚家族 C,成员 4;KLRC4
NKG2F
HGNC 批准的基因符号:KLRC4
细胞遗传学定位:12p13.2 基因组坐标(GRCh38):12:10,407,384-10,409,757(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Plougastel 和 Trowsdale(1997)鉴定了一个位于 NKG2A(161555)3 素端 25 kb 处的基因,他们将其命名为 NKG2F。通过基因组测序和RT-PCR,他们确定完整的NKG2D(611817)转录物是NKG2F的剪接变体,具有相同的前4个外显子。第四外显子内有一个共有剪接供体位点。在长的 13 外显子 NKG2D mRNA 中,该供体位点剪接至外显子 5。在较短的 NKG2F cDNA 中,不使用供体位点,第四个外显子包含额外的 245 bp。序列分析表明,两个转录本都可以编码相同的预测的 158 个氨基酸蛋白质,并且跨越 NKG2D 最后 6 个外显子的第二个开放解读码组可能没有被翻译。NKG2F/NKG2D 蛋白不包含细胞外凝集素结构域,但在细胞外区域具有 24 个氨基酸基序,与其他 NKG2 家族成员的基序 100% 相同。
Glienke et al.(1998)证实,在某些情况下,NKG2F的第四外显子的一部分被剪接到NKG2D的5-prime末端,这与其他NKG2基因的相似性很低。然而,他们指出,已分离出额外的 NKG2D cDNA,但不包含任何 NKG2F 序列,这表明存在功能性 NKG2D 特异性启动子。
▼ 基因功能
Kim等人(2004)利用RT-PCR和Western blot分析表明NKG2F在天然致命物(NK)细胞中在细胞内表达。免疫沉淀分析显示NKG2F未能与CD94(KLRD1;KLRD1)结合。602894),可能解释了表面表达的缺乏。流式细胞术分析证明NKG2F与DAP12(TYROBP;604142),表示活化电位。然而,NKG2F 的免疫受体酪氨酸抑制基序(ITIM)中的酪氨酸并未发生磷酸化,表明该基序是模拟的 ITIM。Kim等人(2004)得出结论,NKG2F可能具有尚未确定的伙伴和功能,或者它可能是一种退化基因产物。
▼ 基因结构
Glienke et al.(1998)确定NKG2C(602891)、NKG2E(602892)和NKG2F基因除了3-prime末端的变异性外,高度相似。NKG2C基因包含6个外显子,而NKG2E有7个外显子,NKG2F只有4个外显子。
▼ 测绘
Plougastel和Trowsdale(1998)通过对粘粒重叠群的分析发现,NKG2F和NKG2D基因以及NKG2基因家族的其他成员聚集在染色体12p13.2-p12.3上350 kb内。该簇位于 NK 复合体内,该区域包含优先在 NK 细胞上表达的 C 型凝集素基因。