间 α-胰蛋白酶抑制剂,重链 4;ITIH4

间 α-胰蛋白酶抑制剂,重链样,1;ITIHL1
间 α-胰蛋白酶抑制剂,重链相关蛋白;IHRP
血浆激肽释放酶敏感糖蛋白 120;PK120

HGNC 批准的基因符号:ITIH4

细胞遗传学定位:3p21.1 基因组坐标(GRCh38):3:52,812,962-52,830,672(来自 NCBI)

▼ 说明

间α-胰蛋白酶抑制剂(ITI)是一类结构相关的血浆丝氨酸蛋白酶抑制剂,参与细胞外基质稳定和预防肿瘤转移。ITI家族包含多种由轻链(见176870)和可变数量的重链组成的蛋白质(Salier et al., 1987;Himmelfarb 等,2004)。

▼ 克隆与表达

Nishimura et al.(1995)鉴定出一个120kD的激肽释放酶-3(KLK3;176820)-来自人血浆的敏感糖蛋白(ITIH4)。这种糖蛋白被他们命名为 PK120,在血浆中以每毫升 80 微克的浓度循环,并被 KLK3 裂解成更小的片段。作者获得了纯化 PK120 的部分氨基酸序列,并据此设计了简并 PCR 引物。他们从人肝脏poly(A)+ RNA中获得了RT-PCR产物,并用它来筛选人肝脏cDNA文库。它们的 3,058 bp 的 PK120 cDNA 编码假定的 28 个氨基酸信号序列,随后是 902 个残基的成熟蛋白质,其中 211 个残基通过蛋白质测序得到证实。Northern 印迹在肝脏中鉴定出较强的 3.3-kb 转录物和较弱的 4-kb 转录物。该序列与间α-胰蛋白酶抑制剂(ITI)超家族具有相似性。

Saguchi等人(1995)报道了血浆中发现的糖蛋白的cDNA序列,他们将其命名为“α-胰蛋白酶抑制剂家族重链相关蛋白”(IHRP)。作者根据部分氨基酸序列设计了PCR引物,用于筛选肝脏cDNA。然后将产物用于筛选肝脏 cDNA 文库。完整的 IHRP cDNA 编码 930 个残基的蛋白质。N端28个氨基酸对应于分泌所需的信号肽。预测蛋白的前三分之二与ITI重链H1(ITIH1; 147270)(52%), H2(ITIH2; 146640)(49%)、H3(ITIH3;146650)(57%)。Northern 印迹分析表明 IHRP 仅在肝脏中表达。

▼ 基因功能

Nishimura等人(1995)推测PK120蛋白水解产物可能与细胞外基质的主要成分透明质酸结合。

▼ 测绘

Tobe等(1995)报道了以2.5kb cDNA片段为探针的荧光原位杂交研究,表明ITIHL1基因位于染色体区域3p21-p14,ITIH1和ITIH3基因也位于该区域。这一结果,连同ITIHL1和其他2个基因的核苷酸序列之间的显着同源性,支持了ITIHL1是ITI重链进化相关基因家族成员的结论。

Jean等人(1997)通过原位杂交将人类ITIH4基因定位到3p21.2-p14.1。他们通过种间回交分析将小鼠 Itih4 基因定位到染色体 14。在人类和小鼠中,ITIH4 基因定位在 ITIH1 和 ITIH3 基因附近。Diarra-Mehrpour et al.(1998)报道,3个ITIH基因以ITIH1--ITIH3--ITIH4排列成一个跨度为45 kb的簇。ITIH4 基因的转录方向与其他基因相反。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 重新分类 - ITIH4 多态性

ITIH4、IVS17、+8、CT(rs3821831)

该变种以前的标题为“HYPERCHOLESTEROLEMIA, SUSCEPTIBILITY TO”,根据 Hamosh(2019)对 gnomAD 数据库的审查进行了重新分类。

Fujita等人(2004)报道了来自日本中东部地区的351名成年人的ITIH4基因内含子17+8位点的C/T单核苷酸多态性(SNP)与血浆总胆固醇水平之间的关联。那些缺乏 T 等位基因的人的血浆总胆固醇水平明显高于其他拥有 T 等位基因的人。在 309 名不带 T 等位基因的个体中,大约 90% 出现高胆固醇血症(见 143890),而在 42 名带有 T 等位基因的个体中,只有 10% 存在高胆固醇血症。他们将这些数据解释为表明 ITIH4 基因座的遗传变异是血浆胆固醇代谢的决定因素。

Hamosh(2019)在gnomAD数据库(2019年6月19日)中发现,该变异以杂合状态存在于282,140个等位基因中的82,160个等位基因和13,332个纯合子中,等位基因频率为0.2912。

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