干扰素-γ-诱导蛋白16;IFI16

HGNC 批准基因符号:IFI16

细胞遗传学定位:1q23.1 基因组坐标(GRCh38):1:158,999,976-159,055,151(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

干扰素是一类脊椎动物细胞因子,具有多效活性,包括抗病毒作用、调节细胞生长和分化以及调节免疫功能。干扰素-γ(IFNG;147570)导致多种细胞上主要组织相容性复合体(MHC)I类和II类蛋白表达增加,从而增强MHC限制性细胞毒性T淋巴细胞的抗原呈递和外来细胞表面抗原识别。Trapani等人(1992)描述了人类IFN-γ诱导基因IFI16,其与2μm IFI基因的部分核苷酸序列相似。全长 cDNA 克隆编码 729 个氨基酸的推定多肽。发现 IFI16 mRNA 在淋巴细胞以及 T 和 B 谱系的细胞系中组成型表达。相比之下,该 mRNA 在代表骨髓发育早期的细胞系中不表达,尽管它在其中 2 个细胞系中可以用干扰素-γ 诱导。

▼ 基因功能

Kerur等(2011)发现卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)感染内皮细胞;参见 148000)导致 IFI16 与转换因子分子 ASC(PYCARD; 606838)和前半胱天冬酶-1(CASP1; 147678)形成功能性炎症小体。该炎性体最初定位于细胞核,随后定位于核周区域。KSHV 与 IFI16 共定位于细胞核中。IFI16 和 ASC 沉默可减少 KSHV 对 CASP1 的激活。Kerur等(2011)得出结论,IFI16是核病原体传感器,炎性小体在细胞质和细胞核中均发挥作用。

Monroe et al.(2014)利用无偏见的蛋白质组学和靶向生化方法,以及两种孤立的慢病毒短发夹RNA介导的原代CD4(186940)T细胞基因敲低方法,确定了IFI16作为CD4 T所需的宿主DNA传感器-由于HIV感染流产而导致的细胞死亡。这些发现提供了对关键宿主途径的见解,该途径在疾病进展为艾滋病期间 CD4 T 细胞耗竭中发挥着核心作用。

▼ 测绘

Choubey et al.(1989)、Kingsmore et al.(1989)等人描述了位于小鼠染色体1上的至少6个干扰素-γ诱导基因。在小鼠中,基因定位到150-kb的DNA片段,以及血清淀粉样蛋白P成分基因(Sap; 参见 104770)定位在 IFN 诱导基因簇的约 450 kb 内。红细胞α-血影蛋白基因(见182860)也密切相关。

Trapani 等人(1992)利用一组种间体细胞杂交细胞系将人类 IFI16 基因定位于 1q12-qter。DNA印迹表明,与小鼠相比,人类IFI16以单拷贝形式存在。

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