RAS 相关蛋白 RAB6C;RAB6C
WTH3
HGNC 批准的基因符号:RAB6C
细胞遗传学定位:2q21.1 基因组坐标(GRCh38):2:129,979,666-129,982,738(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Shan等人(2002)通过甲基化敏感的代表性差异分析,孤立出了在多重耐药MCF7乳腺癌细胞系中高甲基化的RAB6C DNA片段。利用组合人体组织 cDNA 文库的 3-prime RACE,他们获得了全长 RAB6C,他们将其称为 WTH3。推导的 254 个氨基酸的 WTH3 蛋白与 RAB6A(179513)的 2 个亚型具有显着的同源性,但与这些蛋白相比,它具有 C 端延伸。
▼ 基因功能
Shan等人(2002)利用定量RT-PCR发现,与亲本细胞系相比,多重耐药癌细胞系中WTH3的表达降低。多重耐药细胞系中 WTH3 的重新表达增加了它们对包括阿霉素在内的多种抗癌药物的敏感性。流式细胞术和荧光显微镜表明 WTH3 刺激细胞摄取和保留阿霉素。
Tian等(2005)发现,与亲本细胞系相比,多重耐药MCF7细胞的WTH3启动子区高度甲基化。EMSA 显示不同的核蛋白库被高甲基化和非甲基化的 WTH3 探针所吸引。Tian等(2005)得出结论,WTH3的表达受表观遗传修饰和转录因子调节共同控制。
Tian et al.(2007)鉴定出一个p53(TP53;191170)-WTH3基因启动子区的结合位点,表明WTH3在体外和体内均被p53上调。WTH3 的过度表达促进了人类细胞的凋亡表型。Tian et al.(2007)得出结论,WTH3的抗凋亡作用与p53的表达有关。
▼ 基因结构
Tian等(2005)确定RAB6C启动子区含有2个非典型TATA框和2个非典型CAATT框。他们鉴定了一个富含 GC 的区域,其中包括一个 CpG 岛,并从相对于转录起始位点的位置 -485 延伸到 5 素编码区。启动子区域包含几个假定的转录因子结合位点。
▼ 测绘
Hartz(2009)根据RAB6C序列(GenBank AL136727)与基因组序列(build 36.1)的比对,将RAB6C基因定位到染色体2q21.1。