富含脯氨酸的蛋白质 12;PRR12
KIAA1205
HGNC 批准的基因符号:PRR12
细胞遗传学定位:19q13.33 基因组坐标(GRCh38):19:49,591,182-49,626,439(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人(1999)通过对从大小分级的胎脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 PRR12,并将其命名为 KIAA1205。推导的蛋白质含有1,217个氨基酸。
Cordova-Fletes et al.(2015)使用总匀浆分析小鼠和大鼠脑中 Prr12 的表达。免疫印迹分析显示一条 212-kD 条带似乎与人 PRR12 同工型 3 相对应,并且与出生后第 1 天(P1)和成年小鼠相比,在胚胎第 15 天(E15)时该同工型的表达最强。鼠脑并与大鼠 P1 进行比较。作者利用密度梯度分离和蛋白质印迹分析了老鼠大脑中的亚细胞定位,并观察到在所有测试阶段(E15、P1 和成体)表达仅限于细胞核。他们指出,成人大脑中的表达要低得多,这表明 PRR12 在早期中枢神经系统发育中发挥着重要作用。在细胞核内外观察到另一个大约 150 kD 的条带,出现在突触周围、突触体和突触后密度中。作者认为,这种较小的异构体可能具有信号传导作用。
▼ 测绘
Nagase等(1999)通过放射杂交分析将PRR12基因定位到染色体19。Hartz(2015)根据PRR12序列(GenBank AB033031)与基因组序列( GRCh38)。
▼ 细胞遗传学
Cordova-Fletes et al.(2015)报道了一名患有智力障碍和神经精神异常的11岁墨西哥女孩(见NOC;619539)患有从头平衡t(10;19)(q22.3;q13.33)易位。断点的精细定位揭示了染色体 10 上的 ZMIZ1 基因(607159)和染色体 19 上的 PRR12 基因的破坏,导致基因融合引起移码,预计会导致提前终止密码子。作者认为Coffin-Siris样表型(见135900)很可能是由于ZMIZ1改变所致。
▼ 分子遗传学
3名无亲属关系的神经眼综合征儿童(NOC;619539),Leduc 等人(2018)鉴定了 PRR12 基因中从头截短突变的杂合性(参见例如 616633.0001 和 616633.0002)。这些患者均表现出智力障碍、神经精神异常和虹膜异常。虽然所有 3 个突变都影响较长的 PRR12 转录本,但只有 1 个突变也影响较短的转录本,这表明这两个突变中较长的一个可能是功能相关的转录本。
Reis et al.(2021)在来自 4 个患有眼部异常(伴有或不伴有其他非眼部异常)家族的 5 名患者中发现了 PRR12 基因的杂合截短突变(参见例如 616633.0003)。在 gnomAD 数据库中未发现任何变体。作者指出,所有受影响个体的眼部表型都是不对称的,其中 1 名患者仅表现出复杂的眼部异常。
通过GeneMatcher和Matchmaker Exchange的国际合作,Chowdhury等人(2021)鉴定了20名神经眼综合征患者和PRR12基因杂合突变(参见例如616633.0004-616633.0006),其中包括10个移码,5个无义,1个剪接位点,和 2 个错义变体。此外,1名个体在19q13.33-13.41处存在3.352-Mb的缺失,涉及包括PRR12在内的146个基因。如果可能的话,对亲本的测序表明所有 PRR12 变异都是从头发生的;在 gnomAD 数据库中没有找到任何内容。
▼ 等位基因变异体(6个精选例子):
.0001 神经眼综合症
PRR12、GLU640TER
一名4.75岁女孩(患者1)患有神经眼综合征(NOC;619539),Leduc et al.(2018)鉴定了PRR12基因外显子4中c.1918G-T颠换(c.1918G-T, NM_020719)的杂合性,导致glu640到ter(E640X)的取代。父母均未携带该突变,表明该突变是在先证者中从头出现的。作者指出,这种突变仅影响 PRR12 基因的较长转录本。
.0002 神经眼综合症
PRR12、4-BP DEL、4502TGCC
8岁男孩(患者2)患有神经眼综合征(NOC;619539),Leduc et al.(2018)鉴定出 PRR12 基因外显子 6 中 4 bp 缺失(c.4502_4505delTGCC,NM_020719)的杂合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Leu1501ArgfsTer146)。父母均未携带该突变,表明该突变是在先证者中从头出现的。作者指出,这种突变影响了 PRR12 基因的长转录本和短转录本。
.0003 神经眼综合症
PRR12、IVS10、AG、-2
一对患有神经眼综合征的母女(家庭1)(NOC;619539),Reis et al.(2021)在PRR12基因的内含子10中鉴定出剪接位点突变(c.5624-2A-G,NM_020719.2)的杂合性,预计会导致外显子11的跳跃,导致移码和提前终止(Asp1875GlyfsTer54)。在母亲的父亲或 gnomAD 数据库中均未发现该突变;无法从母亲的母亲那里获得 DNA。
.0004 神经眼综合症
PRR12,1-BP DEL,3273C
一名 10 岁女孩(患者 13)和一名无关的 15 个月大男孩(患者 14)患有神经眼综合征(NOC;619539),Chowdhury et al.(2021)鉴定出 PRR12 基因外显子 4 中 1 bp 缺失(c.3273delC,NM_020719.3)的杂合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Lys1092ArgfsTer131)。分离分析显示,突变在两个先证者中都是从头出现的。
.0005 神经眼综合症
PRR12、ARG1169TRP
一名5个月大的菲律宾男孩(患者15)患有神经眼综合征(NOC;619539),Chowdhury et al.(2021)鉴定了 PRR12 基因外显子 4 中 c.3505C-T 转换(c.3505C-T, NM_020719.3)的杂合性,导致 arg1169-to-trp(R1169W) AT-hook 域内的替换。分离分析显示,该突变在先证者中从头出现。
.0006 神经眼综合症
PRR12、LEU1970PRO
一名 15 岁意大利男孩(患者 20)患有神经眼综合征(NOC;619539),Chowdhury et al.(2021)鉴定了 PRR12 基因外显子 13 中 c.5909T-C 转换(c.5909T-C, NM_020719.3)的杂合性,导致 leu1970 到 pro(L1970P)代换。分离分析显示,该突变在先证者中从头出现。