昼夜节律相关转录抑制因子;CIART
COMPUTATIONALLY HIGHLIGHTED REPRESSOR OF NETWORK OSCILLATOR; CHRONO
基因模型 129;GM129
HGNC 批准的基因符号:CIART
细胞遗传学定位:1q21.2 基因组坐标(GRCh38):1:150,282,554-150,287,093(来自 NCBI)
▼ 说明
CIART 被预测为昼夜节律的负调节剂(Annayev et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
Annayev et al.(2014)克隆了小鼠 Ciart,并将其命名为 Gm129。推导的蛋白质含有375个氨基酸。荧光标记的 Gm129 定位于转染的 HEK293T 细胞的细胞核。
Anafi et al.(2014)报道了小鼠Chrono在肝脏、垂体和NIH3T3成纤维细胞中显示昼夜节律表达。他们利用定量PCR证实了小鼠肝脏中的昼夜节律表达,并在骨骼肌和白色脂肪中发现了相似的表达。
▼ 基因功能
Annayev et al.(2014)利用染色质免疫沉淀分析发现,小鼠Gm129的启动子区与昼夜节律转录正调控因子Clock(601851)和Bmal1(ARNTL)结合;602550)和负昼夜节律调节剂Cry1(601933)。Bmal1和Cry1以不同的结合相位有节奏地结合Gm129启动子中的E框。表位标记的 Gm129 与 NIH3T3 成纤维细胞中的内源性 Bmal1 结合。Gm129 在体内和体外与 EBOX DNA 上的 Clock-Bmal1 复合物相互作用,并抑制由 Clock 和 Bmal1 激活的报告基因的表达。Gm129 对 Clock-Bmal1 活性的影响程度与 Cry1 相似,但 Gm129 的功能似乎有所不同,因为 Gm129 不能补偿小鼠中 Cry1 和 Cry2(603732)的双重敲除。
Anafi et al.(2014)孤立地发现,Chrono 与 Bmal1 相互作用并抑制 Bmal1-Clock 转录复合物。Chrono 通过消除 Bmal1 与其转录辅激活因子 Cbp(CREBBP;600140)。
▼ 测绘
Hartz(2014)根据CIART基因(GenBank BC017397)与基因组序列(GRCh37)的比对,将CIART基因定位到染色体1q21.2。
▼ 动物模型
Annayev et al.(2014)以预期的孟德尔频率获得了 Gm129 -/- 小鼠。Gm129 -/- 小鼠没有明显的发育异常,并显示出正常的昼夜节律活动。Gm129 -/- 肝脏仅显示时钟基因表达的微小变化,表明 Gm129 不是主要的昼夜节律调节剂。作者假设 Gm129 可能调节 Clock-Bmal1 控制的转录振荡的相位。
Anafi et al.(2014)发现Chrono敲除小鼠表现出较长的自由运行昼夜节律期。