内质网降解增强 α-甘露糖苷酶样蛋白 2; EDEM2
HGNC 批准基因符号:EDEM2
细胞遗传学定位:20q11.22 基因组坐标(GRCh38):20:35,115,364-35,147,336(来自 NCBI)
▼ 说明
在内质网(ER)中,错误折叠的蛋白质逆向移位到胞质中,并被蛋白酶体降解,这一过程称为内质网相关降解(ERAD)。EDEM2属于参与糖蛋白ERAD的蛋白质家族(Mast et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
通过在人类数据库中搜索与α-甘露糖苷酶编码区相似的序列(参见MAN2A1;154582),Mast et al.(2005)鉴定了EDEM2。推导的 578 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 64.8 kD。它具有 N 端可切割信号序列、甘露糖苷酶同源结构域和 4 个假定的 N-糖基化位点。EDEM2 与 EDEM1(607673)和 EDEM3(610214)分别具有 42% 和 43% 的同一性,与 Edem2 具有 93% 的同一性。Northern印迹分析检测到2-kb转录物的表达,在小肠和外周血白细胞中表达高水平,在脑和骨骼肌中表达低水平,在所有其他检查组织中表达中等水平。免疫荧光分析检测到EDEM2与calreticulin(109091)共定位于ER。
▼ 基因功能
Olivari et al.(2005)表明,哺乳动物Edem2依赖于内质网应激激活转录因子Xbp1(194355),并且Edem2上调通过促进末端错误折叠糖蛋白从钙联蛋白(114217)循环中提取,加速了末端错误折叠糖蛋白的ERAD。
Mast et al.(2005)证明EDEM2与α-1-抗胰蛋白酶(PI1;PI1;107400)并加速错误折叠的α-1-抗胰蛋白酶的ERAD。EDEM2 不参与错误折叠的非糖基化蛋白质的处理。突变分析表明,超出 EDEM2 甘露糖苷酶同源结构域的 C 端延伸对于 ER 保留和 EDEM2 在 ERAD 中的功能至关重要。
▼ 测绘
Mast et al.(2005)通过基因组序列分析,将EDEM2基因定位到染色体20。