丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶 4; PDK4

HGNC 批准基因符号:PDK4

细胞遗传学定位:7q21.3 基因组坐标(GRCh38):7:95,583,499-95,596,516(来自 NCBI)

▼ 说明

PDK4 属于丙酮酸脱氢酶(PDH)激酶家族(EC 2.7.11.2),通过 ATP 依赖性丝氨酸磷酸化复合物 E1 组分的 α 子单元,使线粒体 PDH 复合物可逆失活(参见 300502)( Korotchkina 和 Patel 的总结,2001)。

▼ 克隆与表达

Rowles等人(1996)通过在皮马印第安人中与胰岛素抵抗和NIDDM(125853)相关的7q21.3-q22.1区域进行定位克隆,鉴定出了编码PDK4的基因。PDK4基因编码的蛋白质的计算分子量为46,466。在所有检查的组织中均检测到 PDK4 mRNA,其中心脏和骨骼肌中的水平最高。

▼ 基因结构

Rowles et al.(1996)确定PDK4基因由11个外显子组成,跨度约为16 kb。

▼ 基因功能

PDH 复合物中 E1 的每个 α 子单元包含 3 个被 PDK 磷酸化的丝氨酸。Korotchkina和Patel(2001)利用大肠杆菌表达的重组酶和人E1双位点突变体发现大鼠Pdk1(602524)、Pdk2(602525)和Pdk4以及人PDK3(300906)表现出独特的特异性和活性朝向这些丝氨酸中的每一个。只有 Pdk1 具有可检测到的位点 3 活性,作者将其称为 ser203。在存在或不存在 E2 子单元(DLAT;)的情况下,每种激酶也表现出独特的激酶活性。608770)与E3BP(608769)的复合物,E2硫辛酰基部分的氧化还原和/或乙酰化状态,以及所使用的缓冲系统。

核过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs;参见 PPARA, 170990)是脂肪酸氧化的关键调节剂。Degenhardt et al.(2007)利用实时定量PCR发现,PPAR-β/δ(PPARD;PPARD;600409)激动剂。在小鼠中,PPAR-β/δ 的诱导增加了 Pdk2 和 Pdk4 的肾脏表达,但不增加 Pdk1 或 Pdk3 的表达。在人和小鼠细胞中,PDK4 显示出 PPAR-β/δ 配体最强的诱导作用。其他 PPAR 亚型的配体对 PDK 基因表达的调节较弱。计算机分析、染色质免疫沉淀和蛋白质印迹分析表明,PPAR-β/δ 结合 PDK2、PDK3 和 PDK4 基因中的调控元件,但不结合 PDK1 基因,并与其调控伙伴 RXR-α 相关地激活转录。接收接收;180245), PGC1-α(PPARGC1A; 604517)、TRAP220(MED1;604311)和磷酸化RNA聚合酶II(参见POLR2A,180660)。Degenhardt et al.(2007)还发现,与野生型成纤维细胞相比,Ppard缺失小鼠的成纤维细胞中Pdk2、Pdk3和Pdk4的表达降低。Pdk4 的表达减少了 1200 倍。Degenhardt et al.(2007)得出结论,PDK2、PDK3和PDK4基因是PPAR的主要靶标,PPAR-β/δ是PDK4表达的主要调节因子。

▼ 分子遗传学

Rowles等人(1996)在胰岛素抵抗和胰岛素敏感的皮马印第安人中检测到5种频率相当的DNA变异。使用定量 RT-PCR,他们发现这些变异与骨骼肌和脂肪组织中 mRNA 水平的差异并不对应。Rowles et al.(1996)得出结论,PDK4 的改变不太可能是在皮马印第安人中观察到的 7q21.3-q22.1 连锁的分子基础。

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