CDAN1-相互作用核酸酶 1;CDIN1

染色体 15 开放解读码组 41; C15ORF41

HGNC 批准的基因符号:CDIN1

细胞遗传学定位:15q14 基因组坐标(GRCh38):15:36,579,626-36,810,244(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Babbs等人(2013)通过对转化的B淋巴细胞和培养的正常人成红细胞的总RNA进行RT-PCR,克隆了人C15ORF41。推导的 281 个氨基酸的蛋白质在其 N 端一半有 2 个螺旋-转角-螺旋结构域,在其 C 端一半有一个核酸酶结构域。全局基因表达分析表明C15ORF41在红系分化过程中均匀表达。表达阵列分析显示,C15ORF41广泛表达,在B淋巴母细胞、CD34(142230)阳性细胞、心肌细胞和胎儿肝脏中表达升高,提示其在造血中的特殊要求。数据库分析揭示了 C15ORF41 在真核生物中的保守性,在古细菌和病毒中可能具有直系同源物。

▼ 基因结构

Babbs et al.(2013)确定C15ORF41基因包含11个外显子,跨度超过227.8 kb。

▼ 测绘

Babbs et al.(2013)报道C15ORF41基因定位于染色体15q14。

▼ 分子遗传学

3个无血缘关系的近亲家庭成员患有先天性红细胞生成障碍性贫血Ib型(CDAN1B;Babbs et al.(2013)在C15ORF41基因中鉴定出2个不同的纯合错义突变(L178Q, 615626.0001和Y94C, 615626.0002)。第一个家族的突变是通过全基因组测序发现的,而其他2个家族的突变是通过对9名患有该疾病的先证者的C15ORF41基因直接测序发现的。没有进行突变的功能研究。

▼ 等位基因变异体(2个精选例子):

.0001 贫血,先天性红细胞生成障碍,Ib 型

CDIN1、LEU178GLN

3名受影响的同胞,父母为科威特近亲所生,患有严重先天性红细胞生成障碍性贫血Ib型(CDAN1B;615631),Babbs et al.(2013)在C15ORF41基因的外显子8中鉴定出纯合的c.533T-A颠换,导致疏水核心结构域中高度保守的残基处被leu178替换为gln(L178Q)。该突变是通过全基因组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。它不存在于 dbSNP(build 136)或 Exome Variant Server 数据库或 41 个种族匹配的对照中。没有对该变体进行功能研究。Sabry等人(1997)此前曾报道过该家族。

.0002 贫血,先天性红细胞生成障碍,Ib 型

CDIN1、TYR94CYS

Babbs等人(2013)在2个不相关的巴基斯坦近亲CDAN1B(615631)家族的受影响成员中,在C15ORF41基因的外显子5中发现了纯合的c.281A-G转变,导致tyr94到cys(Y94C)疏水核心结构域中的取代。单倍型分析表明存在创始人效应。尽管残基不是非常高度保守,但半胱氨酸的引入可以形成共价键,从而破坏蛋白质的三级结构。该突变是通过对9名I型CDA先证者的C15ORF41基因直接测序发现的。在dbSNP(build 136)或Exome Variant Server数据库中未发现该突变。其中一个家庭此前曾被 Ahmed 等人(2006)报道过。没有对该变体进行功能研究。

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