SORTING NEXIN 2; SNX2
HGNC 批准基因符号:SNX2
细胞遗传学定位:5q23.2 基因组坐标(GRCh38):5:122,774,996-122,834,543(来自 NCBI)
▼ 说明
SNX2 是分选 nexin 分子家族的成员,该分子包含大约 100 个氨基酸的区域,称为 phox 同源(PX)结构域(Haft 等,1998)。
▼ 克隆与表达
通过数据库检索,按照nexin-1(SNX1;的排序顺序)Haft等人(1998)获得了几个人EST克隆,确定了它们的核苷酸序列,并构建了对应于SNX1(SNX1A)、SNX2、SNX3(605930)和SNX4(605931)亚型的全长cDNAS。SNX2 cDNA 编码推导的 519 个氨基酸的蛋白质,与 SNX1 具有 63% 的序列同一性。Northern印迹分析在所有测试的组织中检测到约3.1和2.4 kb的SNX2转录本,其中在脾、心脏、骨骼肌和外周白细胞中表达最高,在肾、肝和脑中表达低。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将SNX2基因定位到染色体5q23(stSG21976)。
▼ 基因功能
Haft等人(1998)通过Western blot分析表明,SNX1、SNX1A、SNX2和SNX4主要与细胞膜相关,而SNX3主要存在于细胞质中。SNX2 能够与其自身寡聚并与 SNX1、SNX1A 和 SNX4 形成异聚复合物,但不能与 SNX3 形成异聚复合物。当在 COS-7 细胞中表达时,表位标记的 SNX1、SNX1A、SNX2 和 SNX4 与 EGF(131550)、血小板衍生生长因子(参见 173490)和胰岛素(147670)的受体酪氨酸激酶共免疫沉淀。它们还与瘦素受体(601007)的长亚型相关,但与短亚型和中亚型无关。基于其酵母同系物的功能,Haft等人(1998)提出哺乳动物分选连接蛋白在细胞内将蛋白质运输到各种细胞器中发挥作用。
细胞表面受体CED1(107770)介导吞噬细胞对凋亡细胞的识别,从而实现线虫体内细胞尸体的清除。Chen et al.(2010)发现线虫细胞内蛋白质分选复合体retromer通过介导CED1的再循环来清除细胞尸体。哺乳动物逆转录酶复合物包含分选连接蛋白1和2(线虫同源物snx1)和5/6(605937, 606098)(线虫同源物snx6)。逆转录酶被招募到含有细胞尸体的吞噬体表面,其功能丧失导致细胞尸体去除缺陷。逆转录酶可能通过与细胞尸体识别途径中的 CED1 直接相互作用发挥作用。在缺乏逆转录酶功能的情况下,CED1 与溶酶体结合,无法从吞噬体和细胞质再循环到质膜。因此,Chen等人(2010)得出结论,retromer是细胞凋亡过程中通过调节吞噬受体吞噬细胞凋亡的重要介质。