METAXIN 2; MTX2
HGNC 批准基因符号:MTX2
细胞遗传学定位:2q31.1 基因组坐标(GRCh38):2:176,269,442-176,338,025(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Armstrong等人(1999)利用线粒体膜蛋白MTX1(600605)C端的酵母2-杂交分析作为针对小鼠肝脏文库的诱饵,鉴定了一种新的相互作用蛋白,metaxin-2。通过数据库搜索,他们鉴定了相应的 EST,并对小鼠和人 MTX2 cDNA 进行了测序。发现两者都编码推导的 263 个氨基酸的蛋白质,彼此具有 97% 的序列同一性,与 MTX1 的序列同一性为 29%。MTX2 包含 MTX1 中发现的谷胱甘肽 S-转移酶共有序列,但缺乏 C 端线粒体外膜信号锚结构域。小鼠组织的 Northern 印迹分析显示 1.4-kb Mtx2 转录物的普遍表达。亚细胞分离显示 Mtx2 定位于小鼠肾、肺和心脏中的线粒体。线粒体的去污剂处理和酶消化表明 Mtx2 与线粒体外膜的胞质面外围相关。
▼ 测绘
Kantaputra et al.(2010)在染色体2q31.1处鉴定出MTX2基因。
▼ 基因功能
Armstrong等人(1999)发现Mtx2在杆状病毒感染的昆虫细胞中共表达时与Mtx1相关。
使用针对线粒体内膜蛋白mitofilin(IMMT;Xie et al.(2007)通过SDS-PAGE和质谱分析,在人心脏线粒体中鉴定出了一种蛋白质复合物,除了mitofilin之外,还包括SAMM50(612058)、MTX1、MTX2、CHCHD3(613748)、CHCHD6 (615634)、DNAJC11(614827)。
▼ 分子遗传学
5个家系7例下颌骨发育不良早衰综合征(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)鉴定出MTX2基因的纯合突变(608555.0001-608555.0005)。对来自不同家庭的 2 名患者(患者 2 和患者 3)的成纤维细胞进行的研究显示,MTX1 蛋白继发性缺失,且 MTX1 转录水平正常。两名患者的成纤维细胞均发现线粒体异常,包括线粒体网络断裂、DRP1(603850)上调以及多个呼吸链子单元表达降低。患者 2 和 3 的成纤维细胞在暴露于凋亡触发物 TNF-α/放线菌酮和星形孢菌素后细胞死亡减少,但自噬标记物增加。患者成纤维细胞中Lamin A/C(150330)的表达和定位未见异常,但免疫荧光显示核形态异常,包括泡和疝出。用野生型 MTX2-cDNA 转染可挽救患者成纤维细胞中的 MTX1 表达和线粒体网络缺陷。Elouej et al.(2020)得出的结论是,对导致 MDPS 的 MTX2 缺陷的鉴定揭示了线粒体组成和功能与核形态之间的联系。
▼ 动物模型
Elouej et al.(2020)在两种不同的模型中研究了 mtx2 下调对线虫的影响。在第一个模型中,mtx2 在表达 lmn-1:gfp 的线虫菌株中使用 RNAi 下调。Mtx2 下调导致核形态异常和核纤层蛋白-GFP 核聚集体随着年龄的增长而增加。在第二个模型中,Elouej 等人(2020)在体壁肌肉细胞中表达线粒体基质靶向 GFP 的线虫菌株中进行 mtx2 敲除,观察到异常的线粒体形态。这些线虫表现出发育迟缓,几乎没有达到幼年阶段。
▼ 等位基因变异体(5个精选例子):
.0001 下颌骨发育不良早衰综合症
MTX2、MET1LYS
一名印度女孩(患者1),近亲结婚所生,患有下颌骨发育不良早衰综合症(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)在MTX2基因的外显子1中发现了纯合的c.2T-A颠换(c.2T-A, NM_006554.4),导致met1-to-lys(M1K)替换。该突变通过全基因组测序鉴定,并通过桑格测序证实。父母被确认为携带者。在 dbSNP(build 144)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 gnomAD 数据库中均未发现该变体。
.0002 下颌骨发育不良早衰综合症
MTX2、IVS8AS、GC、-1
一名土耳其男孩(患者2),近亲所生,患有下颌骨发育不良早衰综合征(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)在MTX2基因的内含子8中发现了一个纯合的c.544-1G-C颠换(c.544-1G-C, NM_006554.4),导致7-bp缺失外显子 9 的开始以及移码和提前终止(Val182ArgfsTer3)。该突变通过全基因组测序鉴定,并通过桑格测序证实。父母被确认为携带者。在 dbSNP(build 144)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 gnomAD 数据库中均未发现该变体。在患者成纤维细胞中未检测到 MTX2 蛋白,这与可能的蛋白不稳定一致。患者成纤维细胞表现出线粒体网络断裂和 DRP1(603850)上调,这与线粒体分裂增加一致。患者成纤维细胞的呼吸链多个子单元的表达也降低,并且线粒体呼吸异常。成纤维细胞对TNF-α(TNF;191160)诱导细胞凋亡,并且 LC3B-II/LC3B-I 比率增加,表明巨自噬增加。Lamin A/C(150330)免疫荧光分析显示核形态异常。
.0003 下颌骨发育不良早衰综合症
MTX2、IVS4DS、4-BP DEL、+3
一名阿尔及利亚男孩(患者3),近亲结婚生,患有下颌骨发育不良早衰综合征(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)在MTX2基因中内含子4(c.208+3_208+6del,NM_006554.4)的+3位置发现了一个纯合的4-bp缺失,导致外显子4和外显子4的缺失。移码和提前终止(Ala46ValfsTer12)。未检测到 MTX2 蛋白,这与可能的蛋白不稳定一致。该突变通过全基因组测序鉴定,并通过桑格测序证实。该变体不存在于 dbSNP(build 144)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 gnomAD 数据库中。患者成纤维细胞表现出线粒体网络断裂和 DRP1(603850)上调,这与线粒体分裂增加一致。患者成纤维细胞的呼吸链多个子单元的表达也降低,并且线粒体呼吸异常。成纤维细胞对TNF-α(191160)诱导的细胞凋亡具有抵抗力,并且LC3B-II/LC3B-I比率增加,表明巨自噬增加。Lamin A/C(150330)免疫荧光分析显示核形态异常。
.0004 下颌骨发育不良早衰综合症
MTX2、1-BP DEL、NT603
来自埃及近亲家庭的 2 名同胞及其堂兄弟姐妹(患者 4-1、4-2 和 4-3)患有下颌骨发育不良早衰综合症(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)在MTX2基因中发现了一个纯合的1-bp缺失(c.603del, NM_006554.4),预计会导致移码和提前终止(Tyr202IlefsTer26)。该突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。患者4-3的父母被确认为携带者。在 dbSNP(build 144)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 gnomAD 数据库中均未发现该变体。
.0005 下颌骨发育不良早衰综合症
MTX2、2-BP DEL、294TC
厄瓜多尔男孩(患者5)患有下颌骨发育不良早衰综合症(MDPS;619127),Elouej et al.(2020)在MTX2基因的外显子6中发现了一个纯合的2-bp缺失(c.294_295delTC,NM_006554.4),导致了leu99到ter(L99X)的取代。该突变是通过全外显子组测序鉴定的。在 dbSNP(build 144)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 gnomAD 数据库中均未发现该变体。据了解,这对父母不是近亲结婚,但他们出生在厄瓜多尔的同一地区;此外,患者的外显子组数据显示纯合性区域(ROH)总计34 Mb,表明存在古老的近亲繁殖。MTX2 突变位于 5 Mb 的最大常染色体 ROH 内。