含锌指和 BTB 结构域的蛋白质 49;ZBTB49
锌指蛋白 509;ZNF509
HGNC 批准的基因符号:ZBTB49
细胞遗传学定位:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:4,290,251-4,321,783(来自 NCBI)
▼ 说明
ZBTB49 属于包含 BTB/POZ 结构域的蛋白质家族,该蛋白质家族也具有 DNA 结合 Kruppel 样锌指。主要的 ZBTB49 亚型已被证明可以单独或与其他转录调节因子复合地调节基因表达和细胞周期停滞(Jeon 等人,2014)。
▼ 克隆与表达
Jeon等人(2014)使用RT-PCR克隆了人类ZBTB49的4个变体,他们将其称为ZNF509,其内部外显子剪接的不同。全长变体 ZNF509L 编码推导的 765 个氨基酸的蛋白质,其 N 末端有一个 BTB/POZ 结构域,后面是一个间隔区和 7 个串联的 C2H2 型锌指结构域。两个短变体 ZNF509S1 和 ZNF509S2 编码 420 个氨基酸的蛋白质,仅在 C 端残基上有所不同,并且都具有 BTB/POZ 结构域和单个锌指。第三个短变体 ZNF509S3 编码推导的 466 个氨基酸的蛋白质,包含 BTB/POZ 结构域和 2 个锌指。作者指出,ZNF509L、ZNF509S1 和 ZNF509S2 转录本丰富,而 ZNF509S3 转录本稀缺。小鼠组织的半定量 RT-PCR 检测到 Znf509 在白色脂肪组织和肾脏中高表达,在脑、肝脏和心脏中中等表达,在脾脏、棕色脂肪组织和肌肉中较低表达。对转染的 HEK293 细胞进行免疫组织化学分析,检测到表位标记的 ZNF509L 主要在细胞核中并呈点状分布在细胞质中。表位标记的 ZNF509S1 定位于细胞核和细胞质。
▼ 基因功能
Jeon et al.(2014)发现HCT116细胞中ZNF509被DNA损伤诱导剂依托泊苷上调。依托泊苷还上调p53(TP53;191170),它与 ZNF509 启动子中的 p53 响应元件结合,并且是依托泊苷诱导的 ZNF509 上调所必需的。Jeon等人(2014)利用报告基因分析、染色质免疫沉淀分析、敲低和过表达方法以及蛋白质相互作用分析发现,ZNF509的两种主要蛋白亚型ZNF509L和ZNF509S1通过两种不同的方法抑制细胞增殖。ZNF509L通过结合CDKN1A近端启动子中的CG框并诱导转录来激活CDKN1A(116899)的转录。ZNF509L还直接与MIZ1(ZBTB17;604084)和p300(EP300;602700)增强CDKN1A上调。相比之下,ZNF509S1并不直接结合DNA或激活基因表达,而是与MIZF(607099)在RB(RB1;614041)启动子,阻断 MIZF 阻遏物活性并允许 RB 激活。ZNF509L 诱导 CDKN1A 导致 G2/M 期细胞积累,而 ZNF509S1 诱导 RB 导致 G0/G1 和 G2/M 期细胞积累。Jeon等人(2014)通过对人体组织芯片进行免疫组织化学分析,发现ZNF509的表达在多种组织来源的癌症中表达下调。作者得出结论,ZNF509 是一种关键的细胞周期调节剂。
▼ 基因结构
Jeon等(2014)确定ZBTB49基因含有8个外显子。
▼ 测绘
Jeon et al.(2014)指出ZBTB49基因定位于染色体4p16.3。