突触融合蛋白结合蛋白 2; STXBP2
UNC18, 线虫, 同源, 2
UNC18B
MUNC18-2
HGNC 批准的基因符号:STXBP2
细胞遗传学定位:19p13.2 基因组坐标(GRCh38):19:7,629,793-7,647,873(来自 NCBI)
▼ 说明
STXBP2基因编码一种参与多种细胞类型中囊泡货物运输的蛋白质,包括造血细胞以及肠道和肾脏刷状缘的极化上皮细胞。STXBP2是SNARE复合体的一部分,参与膜融合(Pagel等人总结,2012;沃格尔等人,2017;Dhekne 等,2018)。
线虫基因 Unc18 的几种哺乳动物同源物已被鉴定,包括 STXBP2。这些基因在从酵母到人类的各个物种中都是保守的。参见STXBP1(602926)。
▼ 克隆与表达
Ziegler 等人(1996)鉴定了 STXBP2,他们将其称为 UNC18B,作为对 IL2 激活的人类天然致命物(NK)细胞基因进行随机测序的一部分。全长cDNA序列分析显示,其编码593个氨基酸的多肽,与小鼠Unc18b关系最密切(95%相同),与Unc18a(64%相同)和Unc18c(48%相同)关系较弱。 )。Ziegler等人(1996)通过Northern印迹分析发现UNC18B主要以2.4-kb信息的形式在胎盘、肺、肝、肾、胰腺以及外周血淋巴细胞中表达。
▼ 基因结构
Zur Stadt et al.(2009)指出STXBP2基因包含19个外显子。
▼ 测绘
Ziegler et al.(1996)将STXBP2基因定位到人类染色体19p13.3-p13.2和小鼠染色体8的近端臂。
▼ 基因功能
Zur Stadt et al.(2009)通过免疫荧光分析证明了STXBP2和STX11(605014)在CD8+ T和NK细胞中的共定位。IL2(147680)刺激进一步增强了CD8+和NK细胞的共定位。免疫共沉淀分析证明了 STXBP2 和 STX11 之间共有的结合位点。
MUNC18-2或STX11的突变会消除细胞毒性C淋巴细胞(CTL)和NK细胞的细胞毒性,导致免疫缺陷(参见分子遗传学)。Hackmann等人(2013)使用纯化的重组蛋白表明,人类MUNC18-2和STX11直接相互作用,并且该相互作用是由STX11的NHABC结构域促进的。作者提供的证据表明,在缺乏STX11的情况下,STX3(600876)可以与活化的NK细胞中的MUNC18-2相互作用,以补偿细胞毒性所需的缺失步骤。同样,MUNC18-1(STXBP1;602926)可能补偿了 MUNC18-2 的损失,因为 MUNC18-1 在人类 CTL 和 NK 细胞中表达,并与 STX3 和 STX11 相互作用。
▼ 生化特征
Hackmann et al.(2013)以2.6埃的分辨率确定了人类MUNC18-2的晶体结构。与大鼠 Munc18-1 和 Munc18-3 一样,人 MUNC18-2 的结构分为 3 个结构域:结构域 1 和结构域 2 形成拱形结构的一半,结构域 3 主要形成另一半。该结构还包含分子顶部由结构域 1 和结构域 3 形成的中心空腔以及结构域 1 正下方的 N 端肽结合位点,其中包含酸性区域和大的疏水口袋。MUNC18-2 的肽结合表面上也存在扩大的疏水斑块。将 18 个致病突变直接对应到结构上,随后的分析表明,大多数突变影响 MUNC18-2 蛋白的折叠。然而,glu132-to-ala(E132A)突变并没有破坏蛋白质折叠,而是通过破坏N端肽相互作用而消除了MUNC18-2结合STX11的能力。
▼ 分子遗传学
8 名家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(FHL)的无关先证者,定位到染色体 19p(FHL5;zur Stadt等人(2009)对来自2个沙特阿拉伯和6个土耳其近亲家庭的候选基因STXBP2进行了测序,并在所有8名患者中鉴定出STXBP2纯合突变(参见例如601717.0001-601717.0003)。对来自非近亲 FHL 家族的其他患者的序列分析显示,来自德国和捷克共和国的另外 4 名患者的 STXBP2 突变存在纯合性或复合杂合性(参见,例如 601717.0004-601717.0006),其中 2 人之前已报道过(Beutel 等,2017)。 ,2009;Sparber-Sauer 等,2009)。在所有可用的未受影响的父母中都发现了相应的杂合突变,并且在来自种族匹配的对照的 210 个染色体中未检测到任何突变。Zur Stadt et al.(2009)将导致 FHL4(603552)的突变 STX11 鉴定为 STXBP2 的相互作用伴侣,并证明这种相互作用被 FHL5 患者中发现的错义突变所消除,导致 FHL5 患者的稳定性降低。两种蛋白质。FHL5 患者中 NK 和细胞毒性 T 细胞的活性显着降低或缺失。
Cote et al.(2009)在 6 个具有 FHL 染色体 19p13.3-p13.2 的近亲家庭的受影响成员中对 STXBP2 基因进行了测序,并鉴定了 3 个沙特阿拉伯家庭和 IVS14 中 P477L 突变(601717.0001)的纯合性。分别在土耳其、巴勒斯坦、阿拉伯和伊朗起源的3个家系中发现剪接位点突变(601717.0003)。
Cetica et al.(2010)分析了28个FHL家族中的STXBP2基因,其中已知FHL基因的突变已通过序列分析排除,并在28个家族中的4个(14%)中鉴定出STXBP2基因中4个不同错义突变的纯合性。家庭,分别来自意大利、英国、科威特和巴基斯坦(参见例如 P477L, 601717.0001 和 G541S, 601717.0007)。
Pagel等(2012)报道了来自28个不同种族家庭的37名患者因STXBP2基因纯合或复合杂合突变而患有FHL5。此前曾报道过部分患者。有一系列突变类型,包括错义、剪接位点和移码,它们分散在编码区。存在一些反复发生的突变:P477L主要见于阿拉伯裔患者,G541S主要见于欧洲白人,12名患者(5名纯合子和7名复合杂合子)发现影响外显子15(601717.0003)的剪接位点突变。与对照组相比,患者 NK 和细胞毒性 T 细胞表现出不同程度的异常脱颗粒。
Stepensky et al.(2013)在来自 4 个无关家族的 6 名患有与严重肠病相关的 FHL5 的患者中,发现了 STXBP2 基因的双等位基因突变(参见例如 601717.0002 和 601717.0008)。没有对这些变体进行功能研究,但作者假设肠上皮细胞中 PAS 阳性物质的胞吐作用受阻可能最终导致渗透性腹泻。
在 5 名无血缘关系的 FHL5 儿童中,包括 Stepensky 等人(2013)之前报道的 1 名患者,Vogel 等人(2017)在 STXBP2 基因中发现了纯合性功能丧失突变(参见例如 601717.0009 和 601717.0010)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。除了中断与 STX11 的相互作用(一种对正常白细胞功能很重要的相互作用)外,体外研究表明,STXBP2 蛋白的缺失还消除了极化上皮细胞中与 STX3(600876)的相互作用,这对于顶端囊泡融合至关重要质膜。对在多孔膜上生长的 STXBP2 缺失人类肠上皮细胞系和患者来源的细胞或类器官的研究表明,STXBP2 的缺失会破坏肠上皮细胞的极性,并导致顶端微绒毛缩短或丢失以及顶端下囊泡的异常积累。因此,细胞模型系统再现了在患者中观察到的 MVID 表型。Ile232del突变(601717.0002)的表达无法在体外挽救这些缺陷。其他体外研究表明,突变中断了极化细胞顶膜处 SNARE/STX3 介导的货物囊泡融合。这与刷状缘转运蛋白的异常定位有关,例如NHE3(SLC9A3;182307),在顶膜处;这些对于肠上皮细胞的正常功能至关重要。
▼ 基因型/表型相关性
Pagel et al.(2012)根据STXBP2突变类型描绘了2个主要表型FHL5组,表明可能存在基因型/表型相关性。没有外显子 15 剪接位点突变的患者在生命的最初几个月内就发病较早,如果无法进行 HSCT,则病情会迅速致命。本组所有 14 名患者均患有慢性腹泻。相比之下,13 名至少 1 个等位基因上有外显子 15 剪接位点突变的患者发病较晚,病程也更长。本组患者均无腹泻,但有9例出现低γ球蛋白血症。
▼ 等位基因变异体(10个精选例子):
.0001 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴或不伴微绒毛包涵体疾病
STXBP2、PRO477LEU
2名兄弟和另一名来自沙特阿拉伯无关近亲家庭的先证者,患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5,伴或不伴微绒毛包涵体病(FHL5;613101),1岁前,zur Stadt et al.(2009)鉴定出STXBP2基因第16号外显子中1430C-T转变的纯合性,导致保守残基处pro477到leu(P477L)的取代。对两兄弟的 CD107 脱粒分析显示,NK 和细胞毒性 T 细胞的活性显着降低或消失,细胞裂解物的免疫印迹分析显示 STXBP2 含量减少;突触融合蛋白-11(STX11)水平显着下降;605014)也在同胞中观察到。免疫共沉淀研究表明 P477L 突变体不具备结合 STX11 的能力。其中一名兄弟在12月龄时接受了错配无关供体造血干细胞移植(HSCT),最近随访时无活动性疾病;另一个患有中枢神经系统受累的兄弟在 3 个月大时接受了匹配的非亲属供体 HSCT,但后来死于静脉闭塞性疾病。
在患有 FHL5 的 3 个不相关的沙特阿拉伯近亲家族的受影响成员中,Cote 等人(2009)鉴定出 STXBP2 基因中 P477L 突变的纯合性。在 1 个家庭 2 名受影响的女性同胞的淋巴母细胞中未检测到 STXBP2 蛋白。父母和未受影响的同胞都是突变 STXBP2 等位基因的杂合子,而在 80 名法国人、50 名土耳其人、80 名阿拉伯人或伊朗对照者中未发现该突变。5名患者均在1至3.5个月大时确诊,5名患者中有3名在4至16个月大时死亡。
Cetica 等人(2010)在一名 7 个月大时被诊断为 FHL 且在接受匹配同胞供体 HSCT 后 3.5 岁时仍存活的科威特女孩中,鉴定出 STXBP2 基因中 P477L 突变的纯合性。
Pagel等人(2012)在一名来自阿拉伯联合酋长国的近亲父母出生的2.2岁男孩(A_679)中发现了纯合的P477L突变,带有FHL5。他还因肠病而患有慢性腹泻。
.0002 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴或不伴微绒毛包涵体疾病
STXBP2、3-BP DEL、693GAT
2名来自近亲家庭的无关土耳其先证者,患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5,伴或不伴微绒毛包涵体病(FHL5;zur Stadt et al.(2009)分别在1.5月龄和2月龄时鉴定出STXBP2基因外显子9中3-bp缺失(693_695delGAT)的纯合性,导致保守残基处的ile232缺失。免疫共沉淀研究表明,ile232 缺失后不具备结合 STX11 的能力。两名患者均出现中枢神经系统受累;一名患者在 4.5 个月大时接受了同胞供体相匹配的造血干细胞移植(HSCT),并在大约 8 年的随访中没有出现活动性疾病,而另一名患者则没有接受 HSCT 并死亡。
Stepensky et al.(2013)在近亲父母(家庭1)所生的3名同胞的STXBP2基因中发现了纯合的c.693_695delGAT突变,带有FHL5。其中两人在出生后的头几个月因顽固性腹泻和凝血异常而死亡。第三位同胞接受了骨髓移植,12岁时仍存活,但移植后腹泻和肠病持续存在;她正在接受肠外营养。
.0003 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,无微绒毛包涵体疾病
STXBP2、IVS14AS、GC、-1
2名土耳其和德国血统的无亲缘关系的先证者,患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症,无微绒毛包涵体病(FHL5;zur Stadt et al.(2009)分别在28个月和44个月时鉴定了STXBP2基因第14内含子(1247-1G-C)剪接受体位点上G-C颠换的纯合性。对土耳其患者的 RNA 分析显示,约 95% 的克隆中存在 15 号外显子缺失,导致出现移码和 126 个新密码子,以及 2 个次要的框内产物和 4 个移码产物。该患者的 CD107 脱颗粒分析显示 NK 和细胞毒性 T 细胞的活性显着降低或消失。德国患者16岁时接受了相配的非亲缘供者造血干细胞移植(HSCT),但随后死亡。这名土耳其患者没有接受造血干细胞移植,但其反复激活对类固醇有反应。另外3例无关的FHL患者均在1岁后发病,剪接位点突变存在于复合杂合性中,分别有一个错义突变(601717.0004)和2个不同的1-bp缺失(601717.0005和601717.0006)。
Cote et al.(2009)在分别来自土耳其、巴勒斯坦、阿拉伯和伊朗血统近亲家族的 3 名 FHL5 先证者中鉴定出 STXBP2 基因中 1247-1G-C 突变的纯合性。RT-PCR产物的测序表明,剪接突变并没有导致过早终止密码子,而是导致外显子15的前17个氨基酸替换为内含子序列中的19个新氨基酸,与最后20个氨基酸符合读码框野生型外显子 15 的酸。父母都是突变 STXBP2 等位基因的杂合子,在 80 个法国人、50 个土耳其人、80 个阿拉伯人或伊朗人对照中未发现该突变。土耳其和伊朗患者的淋巴细胞显示 STXBP2 蛋白表达显着降低。在土耳其患者(其 2.6 岁时仍无症状的纯合兄弟)和伊朗患者中,培养的 NK 细胞表现出细胞毒性颗粒胞吐作用受损;该缺陷通过野生型 STXBP2 的异位表达得到克服。3 名有症状的先证者在 8 岁至 12.5 岁之间被诊断。这名伊朗患者在 HSCT 后于 20 岁时死亡,她的一名妹妹在 22 个月大时去世,回顾性诊断为 FHL5。
Pagel et al.(2012)在12名FHL5患者中鉴定出c.1247-1G-C突变;5 名患者为纯合子,7 名患者为与另一种致病性 STXBP2 变异的复合杂合子。此前曾报道过部分患者。对患者细胞的分析发现了一个主要的异常转录本,预计会导致提前终止(Val417LeufsTer126)。体外研究表明该截短蛋白无法与STX11(605014)相互作用。在IL2刺激后,有缺陷的NK细胞脱颗粒得到改善,并且CTL细胞毒性在这些测试的患者中正常,这表明外显子15剪接位点突变可能具有残余功能。Pagel et al.(2012)观察到,与没有外显子 15 剪接位点突变的患者相比,携带至少 1 个等位基因上的外显子 15 突变的患者发病稍晚,病程更长,并且没有微绒毛包涵体病(MVID) 。
.0004 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,无微绒毛包涵体疾病
STXBP2、LEU209PRO
一名德国患者患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5,不伴微绒毛包涵体病(FHL5;zur Stadt et al.(2009)在28个月大时鉴定出剪接位点突变(601717.0003)和STXBP2基因外显子8中的626T-C转变的复合杂合性,导致leu209到pro(613101)。 L209P)替代。该患者的 CD107 脱颗粒分析显示 NK 和细胞毒性 T 细胞的活性显着降低或消失。患者有中枢神经系统受累和反复再激活,并有自发缓解或对类固醇有反应。
.0005 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,无微绒毛包涵体疾病
STXBP2,1-BP DEL,260T
一名德国患者患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5,不伴微绒毛包涵体病(FHL5;zur Stadt et al.(2009)在15月龄时发现了STXBP2基因外显子5中剪接位点突变(601717.0003)和1-bp缺失(260delT)的复合杂合性,导致移码和早产。蛋白质的终止。该患者7岁时接受了匹配的非亲缘供者造血干细胞移植,但随后死亡。
.0006 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,无微绒毛包涵体疾病
STXBP2、1-BP 删除、706G
一名患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5(不伴微绒毛包涵体病)的捷克患者(FHL5;zur Stadt et al.(2009)在15月龄时接受了错配的无关供体造血干细胞移植,并在28月龄时接受了不相配的无关供体造血干细胞移植,并且在最后一次随访时没有活动性疾病,zur Stadt et al.(2009)鉴定出了剪接位点突变的复合杂合性(613101)。 601717.0003)和STXBP2基因外显子9中的1-bp缺失(706delG),导致移码和蛋白质提前终止。
.0007 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴或不伴微绒毛包涵体疾病
STXBP2、GLY541SER
英国一名白人女孩患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5,无微绒毛包涵体病(FHL5;613101),Cetica et al.(2010)鉴定了STXBP2基因外显子18中1621G-A转变的纯合性,导致高度保守残基处的gly541到ser(G541S)取代。在 120 名健康白种人对照中未发现该突变。生化分析表明,G541S 突变体破坏了 STXBP2 与 STX11(605014)的结合。使用患者淋巴细胞进行颗粒释放试验,结果显示 NK 细胞中的释放量极少,CD3(+)CD8 细胞中完全没有释放;患者的细胞毒性 T 细胞淋巴细胞表现出细胞杀伤能力降低但并非不存在。在接受匹配的无关供体 HSCT 后,她在 2.75 岁时仍然活着。
Pagel等人(2012)在3名无血缘关系的欧洲血统儿童(A_376、A_032和A_474)中发现了STXBP2基因的复合杂合突变。所有 3 个基因的 1 个等位基因均携带 G541S,而另一个等位基因则携带假定致病性变异(分别为外显子 2、I104F 和 L534P 的剪接位点突变)。没有对后一种变体进行功能研究。患者在出生后的头几个月发病;1 人在 7 个月大时死亡。一名患者因肠病而患有慢性腹泻,另外两名患者患有感音神经性听力损失。
Pagel等(2012)还报道了一名19岁德国女孩(A_711),其FHL5发病较晚,为G541S复合杂合子,存在影响外显子15(c.1356+1G-A)的剪接缺陷。没有进行剪接位点突变的功能研究。该患者于 13 岁时确诊,并于 17 岁时接受 HSCT。她没有肠病。
.0008 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴有微绒毛包涵体疾病
STXBP2、ARG405GLN
巴基斯坦近亲父母(家庭4)所生女婴患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5伴微绒毛包涵体病(FHL5;613101),Stepensky et al.(2013)在STXBP2基因中发现了一个纯合的c.1214G-A转换(c.1214G-A, NM_006949.2),导致arg405到gln(R405Q)的取代。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。除了该疾病的主要特征外,该患者还患有慢性腹泻和发育迟缓,并在 12 个月大时接受了骨髓移植。
.0009 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴有微绒毛包涵体疾病
STXBP2、IVSDS、GA、+5
一名患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症-5并伴有微绒毛包涵体病的男孩(患者3)(FHL5;613101),Vogel et al.(2017)鉴定了纯合的G-to-A转变(c.902+5G-A),预计会导致剪接缺陷。该突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。尚未对该变体进行功能研究,但预计会导致功能丧失。
.0010 噬血细胞淋巴组织细胞增多症,家族性,5,伴有微绒毛包涵体疾病
STXBP2,1-BP DEL,1146C
2 兄弟(患者 4 和 5),父母为巴基斯坦近亲所生,患有家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症 5 型微绒毛包涵体病(FHL5;613101),Vogel et al.(2017)在STXBP2基因中发现了一个纯合的1-bp缺失(c.1146delC),导致移码和提前终止(Lys383ArgfsTer4)。该突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。尚未对该变体进行功能研究,但预计会导致功能丧失。