聚合酶 II,RNA,子单元 F; POLR2F
RPB6,酿酒酵母,同源物
RNA 聚合酶 II, 14.4-KD 子单元
HGNC 批准的基因符号:POLR2F
细胞遗传学定位:22q13.1 基因组坐标(GRCh38):22:37,953,663-38,041,915(来自 NCBI)
▼ 正文
DNA依赖性RNA聚合酶II(EC 2.7.7.6)负责蛋白质编码基因的转录。它由 10 至 14 个子单元组成,质量范围约为 220 kD(POLR2A;180660)至约7 kD(POLR2K;606033)。有关 RNA 聚合酶 II 的结构和功能的一般信息,请参阅 180660。
▼ 克隆与表达
通过使用部分 POLR2F cDNA 序列(Adams 等人,1991)获得的探针筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库,Acker 等人(1994)分离了代表 RNA 聚合酶 II 子单元 POLR2F 整个编码序列的 cDNA,他们将其称为 RPB14.4。推导的 127 个氨基酸 POLR2F 蛋白的计算分子量约为 14.4 kD。它呈强酸性,计算等电点为 3.7。POLR2F 包含预测的 C 端亮氨酸拉链结构域,其前面没有基本结构域。POLR2F 蛋白与酿酒酵母聚合酶子单元 ABC23 具有 49% 的序列同一性,其中 C 端区域显示出最高的保守性。
▼ 基因结构
Pusch等人(1996)发现POLR2F基因全长13,083 bp,包含5个外显子。
▼ 测绘
Pusch et al.(1996)鉴定了粘粒内的 POLR2F cDNA 序列,该序列对应到 22q13.1。他们表示POLR2F基因距离PDGFB基因(190040)不超过600 kb。
▼ 生化特征
晶体结构
Cramer 等人(2000)使用扩展至 3 埃分辨率的 X 射线衍射数据导出了 10 子单元酵母 RNA 聚合酶 II 的主干模型。所有10个子单元都表现出与相应的人类蛋白质的高度同一性,并且10个子单元中的9个在3种真核RNA聚合酶I、II和III中是保守的。该模型的显着特征包括一对由子单元 Rpb1(180660)、Rpb5(180664)和 Rpb9(180662)形成的钳口,它们似乎可以抓住活性中心下游的 DNA。由Rpb1、Rpb2(180661)和Rpb6(与人POLR2F同源)形成的靠近活性中心的DNA上的钳子可以被RNA锁定在闭合位置,这使得转录复合物具有很大的稳定性。活性中心下方的蛋白质复合物中的孔可以允许聚合底物进入,并在校对和通过 DNA 中的暂停位点期间允许转录物退出。