细胞周期L2; CCNL2
HGNC 批准基因符号:CCNL2
细胞遗传学定位:1p36.33 基因组坐标(GRCh38):1:1,385,711-1,399,335(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
de Graaf等(2004)通过筛选人胎脑表达文库中与核蛋白激酶DYRK1A(600855)结合并被其磷酸化的蛋白,并进行数据库分析,鉴定出3个CCNL2转录本。最长的转录本 T1 长约 4.5 kb,包含所有 CCNL2 外显子,包括引入终止密码子的选择性剪接外显子 6a。T1 编码一个截短的 CCNL2 蛋白,缺少全长 CCNL2 的 RS 结构域。T2 转录物长约 2.4 kb,缺少外显子 6a,编码全长 CCNL2 蛋白。转录本 T3 长约 1.2 kb,在外显子 6a 中包含替代多聚腺苷酸化信号,并且缺少所有其他外显子。T3 和 T1 编码相同的截短蛋白质。de Graaf 等人(2004)使用外显子特异性探针进行 Northern blot 分析,发现在所有检查的组织中都有可变的 T1 表达。T2主要在睾丸中表达,T3在几乎所有组织中均弱表达。PCR分析得到相似的结果,T1和T3在胰腺中高表达,T2在睾丸中高表达。
Loyer等人(2008)利用Northern印迹和RT-PCR分析鉴定了5种不同的细胞周期蛋白L2剪接变体,它们在人脑、肝脏、睾丸、脾脏和胸腺中以组织依赖性方式不同地表达。这 5 个变体具有 3 个不同的 ORF,编码细胞周期蛋白 L2-α、L2-β-A 和 L2-β-B 亚型,它们的 C 末端不同。对几种人类细胞系的免疫荧光分析检测到核质和大核斑点中的所有细胞周期蛋白 L1 和 L2 同工型,并显示与 CDK11 的 p110 同工型共定位(参见 CDK11A;116951)。
▼ 基因功能
de Graaf 等人(2004)利用 FRAP 分析和活细胞成像表明,荧光标记的 CCNL2 短暂定位于 COS-7 细胞的核斑点上。全长 CCNL2,但不是缺少 RS 结构域的亚型,在 Pull-down 测定中与 DYRK1A 相关。CCNL2还与DYRK2(603496)和p110 PITSLRE相互作用。体外磷酸化测定表明,DYRK1A 在 ser330、ser338 和 ser369 上磷酸化 CCNL2,所有这些位置均位于脯氨酸残基的 N 端。De Graaf et al.(2004)得出结论,CCNL2是核斑点中高度移动的成分,DYRK1A可能通过磷酸化CCNL2来调节剪接。
Loyer等人(2008)通过免疫沉淀分析和人类细胞系的蛋白质下拉实验发现,细胞周期蛋白L1和L2的α和β同工型,而非细胞周期蛋白L1的γ同工型,与CDK11的p110同工型相互作用。在体外表现出剪接活性的高分子质量复合物中。细胞周期蛋白 L1 和 L2 的 α 同工型也与 CDK11 的 p58 和 p46 同工型相互作用。体内剪接测定表明,细胞周期蛋白 L1-α、L1-β、L2-α 或 L2-β 和/或 p110 CDK11 的表达增加了内含子剪接活性,并改变了细胞周期蛋白 L1 和 L2 亚型中的选择性剪接位点选择。和细胞类型特异性的方式。
▼ 基因结构
De Graaf et al.(2004)确定CCNL2基因至少包含11个外显子,跨度约13 kb。选择性剪接的外显子 6a 含有选择性终止密码子和聚腺苷酸化位点。CCNL2 基因的 3-prime 区域包含 2 个额外的聚腺苷酸化位点。
Loyer et al.(2008)指出CCNL2基因包含14个外显子,跨度约为11.8 kb。
▼ 测绘
de Graaf等(2004)通过基因组序列分析,将CCNL2基因定位到染色体1p36.33。
▼ 历史
Yang et al.(2004)描述CCNL2的克隆和功能的文章被撤回。