过氧化物酶体生物生成因子 5 样;PEX5L
PEX5相关蛋白;PEX5R
PXR2B
TRIP8B
HGNC 批准的基因符号:PEX5L
细胞遗传学定位:3q26.33 基因组坐标(GRCh38):3:179,794,958-180,036,937(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Amery et al.(2001)以PEX5(600414)为探针,通过EST数据库分析,随后进行PCR,克隆了3个PEX5L剪接变体。脑源性 cDNA 编码 624 和 626 氨基酸蛋白,与 PEX5 具有 39.8% 的同一性。较短的 344 个氨基酸蛋白源自肝脏 cDNA,与 C 端 PEX5 具有 54% 的氨基酸同一性。所有 3 个亚型均含有四肽重复基序(TPR)。Northern 印迹分析检测到 8.3-kb、4.3-kb 和 3.3-kb 转录本在人脑中表达最高,在胰腺中信号较弱。对 50 种人体组织的 RNA 斑点印迹分析证实,其在大脑所有部位都有表达,但在睾丸和垂体中表达较低。免疫荧光研究将 PEX5L 定位于小鼠 Pex5 -/- 成纤维细胞和中国仓鼠卵巢细胞的细胞质。
Santoro et al.(2009)鉴定了小鼠 Pex5l 的 9 个剪接变体,他们将其称为 Trip8b。所有变体均包含 2 个替代起始密码子中的 1 个,每个密码子均编码在单独的外显子(外显子 1a 和 1b)中,后面是 3 个后续外显子(外显子 2 至 4)的不同组合。外显子 5 至 16 中没有发生变异。推导的蛋白质具有独特的 7 至 112 个氨基酸的 N 末端,后面是相同的 560 个氨基酸序列。共同序列包含2个适应素(见600157)结合基序和6个C端四肽重复序列。独特的 N 末端区域可能包含最多 2 个额外的适应素结合基序。实时定量 PCR 检测到小鼠大脑中 Trip8b 变体的可变表达。
▼ 基因功能
Amery等人(2001)通过体外结合研究和酵母2-杂交分析表明,PEX5L亚型的含有TPR的结构域与过氧化物酶体靶向信号PTS1结合;然而,与 PEX5 不同的是,PEX5L 不结合其他过氧化物酶。Pex5 -/- 成纤维细胞中转染的 PEX5L 未能恢复这些细胞表现出的过氧化物酶体蛋白输入缺陷,这表明虽然 PEX5L 结合含有 PTS1 的蛋白,但它不能在功能上替代 PEX5。
Santoro等人(2009)通过对小鼠大脑cDNA文库的酵母2-杂交分析表明,Hcn1通道(602780)与Trip8b强烈结合。Hcn1与非洲爪蟾卵母细胞或大鼠海马神经元中6个小鼠Trip8变体中的每一个的共表达显示,2个变体增加了Hcn1表面表达,3个变体降低了Hcn1表面表达,1个变体对Hcn1表面表达没有影响。所有 6 个变体都对 Hcn1 通道开放产生类似的抑制作用,将其激活电压转向更负的电位,这可能是通过拮抗 cAMP 增强 Hcn1 通道开放的能力。免疫沉淀和蛋白质印迹分析揭示了 Trip8b 与 AP2(参见 601026)转换因子复合物的特异性关联。Santoro et al.(2009)得出结论,TRIP8B作为转换因子蛋白来调节HCN1通道的表面表达或内吞作用。
Piskorowski et al.(2011)发现,所有Trip8b亚型的敲除导致Hcn1在整个小鼠CA1体细胞树突区室中被错误定位。相比之下,在选择性缺乏外显子 1b 和 2 的 Trip8b 敲除小鼠中,Hcn1 通常靶向 CA1 锥体远端树突。在 2 个剩余的海马 Trip8b 亚型中,一个含有外显子 1a 和 4 的亚型促进树突中 Hcn1 的表面表达,而另一个含有外显子 1a 和 4 的亚型促进树突中 Hcn1 的表面表达。仅包含外显子 1a 抑制轴突中 Hcn1 的错误表达。含有外显子 1b 的 Trip8b 同种型主要在少突胶质细胞中表达。
▼ 测绘
Amery等(2001)通过基因组序列分析,将PEX5L基因定位到染色体3q26.2-q27。