长基因间非编码 RNA 598;LINC00598

lincRNA 598
TTL

HGNC 批准的基因符号:LINC00598

细胞遗传学定位:13q14.11 基因组坐标(GRCh38):13:40,347,132-40,481,006(来自 NCBI)

▼ 说明

长非编码RNA(lncRNA),例如LINC00598,是长度超过200 bp的非编码转录物,充当蛋白质编码基因的转录和转录后调节因子。LINC00598通过调控CCND2(123833)的转录在细胞周期调控和增殖中发挥作用(Jeong et al., 2016)。

▼ 克隆与表达

通过寻找FOXO1A基因(136533)附近的lncRNA,Jeong et al.(2016)鉴定出了LINC00598。LINC00598 产生 3 个剪接变体,所有这些变体都缺乏编码潜力。定量RT-PCR显示LINC00598在9种人类细胞系中表达,Northern印迹分析显示最长的变体是HEK293T细胞中的主要形式。HEK293T 细胞的分级分离和 RNA-FISH 分析显示 LINC00598 定位于细胞核。

▼ 基因结构

Jeong et al.(2016)报道LINC00598基因包含7个外显子。

▼ 测绘

Jeong等(2016)报道LINC00598基因定位于染色体13q14.11,位于FOXO1A基因和COG6基因之间(606977)。

▼ 基因功能

Jeong等人(2016)利用敲低和微阵列分析表明,显性LINC00598变体在HEK293T细胞中充当各种靶基因(包括CCND2)的转录调节因子。LINC00598 通过降低 FOXO1(CCND2 的负调节因子)与 CCND2 启动子的结合亲和力来调节 CCND2 的表达。HEK293T 细胞中 LINC00598 的敲低诱导 G0-G1 细胞周期停滞并抑制细胞增殖。CCND2 的过表达挽救了 LINC00598 敲低细胞中的 G1 期停滞,这表明 LINC00598 通过 CCND2 的转录调节来调节 G0-G1 检查点,从而调节细胞增殖。

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