真核转录起始因子3,子单元E;EIF3E
真核转录起始因子 3, 48-KD; EIF3-p48
癌基因 INT6;INT6
真核转录起始因子 3, 子单元 6, 前; EIF3S6, 前
此条目中代表的其他实体:
乳房肿瘤病毒整合点位家族6,包括
HGNC 批准的基因符号:EIF3E
细胞遗传学定位:8q23.1 基因组坐标(GRCh38):8:108,201,216-108,248,717(来自 NCBI)
▼ 说明
EIF3E 编码真核起始因子-3(eIF3)子单元,是最大的 eIF,通过促进起始子甲硫氨酰-tRNA 和 mRNA 与 40S 核糖体子单元结合,在起始途径中发挥核心作用(摘要)浅野等人,1997)。
▼ 克隆与表达
真核起始因子3(eIF3)是最大的eIF,在哺乳动物中由至少10个不相同的子单元组成。参见第66页(EIF3S7;603915)。Asano等人(1997)通过用兔eIF3-p48子单元的部分蛋白序列检索EST数据库,鉴定出编码人p48的cDNA。预测的人类p48蛋白含有445个氨基酸。重组 p48 与 eIF3 和 eIF3-p170(602039) 子单元共免疫沉淀。Northern 印迹分析显示 p48 在 HeLa 细胞中表达为 1.6 kb mRNA。Asano et al.(1997)发现人类p48与小鼠int6基因产物相同。老鼠int6基因是老鼠乳腺肿瘤病毒(MMTV)经常整合的位点,这可能导致截短的int6蛋白的表达。这些作者还指出,int6 已被鉴定为一种人类蛋白,可与人类 T 细胞白血病病毒 I 型 Tax 蛋白结合,导致 int6 从细胞核易位至细胞质。他们提出了 p48 癌蛋白功能的模型。
Miyazaki et al.(1997)给出了Int6的人类同源物的完整核苷酸序列。推导的人类基因产物的氨基酸序列与小鼠蛋白相同,并且包含3个潜在的校准起始信号。
▼ 基因功能
Yin6 是人类 INT6 的酵母同源物,与肿瘤发生有关。Yen et al.(2003)表明Yin6结合并调节蛋白酶体活性。Yin6的过表达增强了蛋白酶体的功能,而失活则削弱了它的功能,并导致多泛素化蛋白的积累,包括Cut2/securin(PTTG1; 604147)和Cdc13/细胞周期蛋白B(CCNB1;123836)。Yin6通过优先与Rpn5(PSMD12;PSMD12;604450),一个保守的花生体子单元,并影响其定位/组装。Yin6还与Ras1(190020)配合介导染色体分离;Ras1 类似地通过 Rpn5 调节蛋白酶体。在酵母中,人 INT6 结合 Rpn5 并调节其定位。作者得出结论,人类 INT6,无论是单独还是与 RAS 合作,都通过 RPN5 影响浣熊体活性。他们提出,INT6 失活会导致有丝分裂调节因子的积累,影响细胞分裂和有丝分裂保真度。
▼ 基因结构
Miyazaki et al.(1997)确定INT6基因包含13个外显子,跨越45 kb的基因组DNA。
▼ 测绘
Miyazaki et al.(1997)通过对中国仓鼠/人类体细胞杂交体的分析,将人类INT6基因定位到8q22-q23,其中唯一的人类补体是染色体8。他们之前已经表明,染色体15上的Int6基因, 16 cM Myc 位点着丝粒(190080)。小鼠染色体 15 的这个区域在人类染色体 8q 上是保守的。处理后的 INT6 假基因定位于 6q。
▼ 分子遗传学
为了确定INT6是否是肿瘤发展过程中突变的靶标,Miyazaki等人(1997)调查了100个原发性乳腺肿瘤DNA。他们发现 39 个原发性乳腺癌 DNA 中的 11 个(28%)存在杂合性丢失(LOH),这些 DNA 为 INT6 内含子 7 的多态性序列提供了信息。对这些肿瘤 DNA 中剩余等位基因的单链构象和杂交错配分析未能检测到任何突变。