剪接体相关因子 3,U4/U6 回收蛋白; SART3

T 细胞识别的鳞状细胞癌抗原 3
TAT 相互作用蛋白,110-KD:TIP110
p110
KIAA0156

HGNC 批准的基因符号:SART3

细胞遗传学定位:12q23.3 基因组坐标(GRCh38):12:108,522,214-108,561,173(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(1995)通过对从大小分级的人骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 SART3,并将其命名为 KIAA0156。推导的 963 个氨基酸的蛋白质具有假定的 RNP1 RNA 结合结构域,并与非洲爪蟾核仁素(NCL;164035)。Northern印迹分析检测到睾丸中SART3表达最高,而除胰腺外的所有其他检查组织中表达较低。

采用表达克隆策略鉴定可激活HLA-A2402(见142800)限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的肿瘤抗原,然后筛选来自食管鳞状细胞癌细胞系和正常外周血单核细胞的cDNA文库( Yang等(1999)克隆了SART3。推导的 963 个氨基酸蛋白具有 2 个 RNA 结合基序、2 个核定位信号、一个推定的酪氨酸磷酸化基序和一个 RGD 细胞附着序列。Northern 印迹分析检测到 3.8 kb 转录物的普遍表达。蛋白质印迹分析显示胎儿肝脏的胞质部分以及成人睾丸的胞质和核部分中存在 140-kD SART3 蛋白。SART3 在所检查的所有增殖培养人类细胞的胞质溶胶中表达。

通过搜索酵母 Prp24 同源物的数据库,Bell 等人(2002)鉴定了人类 SART3,他们将其称为 p110。SART3 包含 7 个不完美的 N 端四肽(TPR)重复序列,或“半个 TPR”(HAT)基序,这些基序在酵母 Prp24 中不存在。

Liu et al.(2004)在SART3中鉴定出一个LxxLL基序,或核受体(NR)框。NR 框存在于类固醇激素受体的共调节因子中。

Harada et al.(2000)克隆了小鼠Sart3,其编码的蛋白质与人类SART3 86%相同。Northern印迹分析检测到小鼠中普遍存在表达,其中睾丸、胸腺、脾脏和肺中的表达水平最高。Sart3从妊娠第7天开始在胚胎小鼠中表达,此后表达增加。

▼ 基因功能

Yang等人(1999)在SART3蛋白中鉴定出2种肽,它们被HLA-A2402限制性CTL识别,并且能够从大多数HLA-A24阳性癌症患者的PBMC中诱导HLA-A24限制性和肿瘤特异性CTL经测试,但并非来自健康捐赠者的 PBMC。

mRNA 剪接需要将前 mRNA 组装成一个大的、动态的 RNA-蛋白质复合物,即剪接体,其中 5 个小核 RNA 和 50 多种蛋白质成分被整合成功能性小核核糖核蛋白(snRNP)。Bell等人(2002)利用HeLa细胞裂解物的免疫沉淀分析和体外结合测定表明SART3与U6(180692)和U6/U4 snRNPs相关。重组 p110 结合 U6 snRNA 的内部区域,其中包含保守的 ACAGAG 序列和环序列。免疫耗竭和重建实验表明,SART3 作为 U6 特异性回收因子,负责从剪接体后游离的 U4 和 U6 snRNP 再生碱基配对的 U4/U6 snRNP。

Stanek et al.(2003)利用免疫荧光分析表明,SART3仅定位于HeLa细胞核,分布在整个核质和含有线圈蛋白(COIL; 600272),卡哈尔体的标记。U6 snRNP Sm-like(LSM)蛋白(例如LSM2;607282),参与U4/U6 snRNP组装,也定位于卡哈尔体。转录抑制减少了 LSM 和 SART3 在 HeLa 细胞 Cajal 小体中的定位,表明它们在 Cajal 小体中的定位反映了依赖于转录和/或剪接的活跃过程。SART3 的 N 端 HAT 结构域对于蛋白质靶向 Cajal 小体是必要且充分的。HAT 结构域的过表达对 U6 snRNP 定位到 Cajal 小体具有显性负效应,表明内源 SART3 在将 U6 snRNP 定位到 Cajal 小体中发挥作用。

Liu等人(2004)证明SART3(他们称之为TIP110)与雄激素受体(AR;AR;313700)并在报告基因检测中抑制 AR 活性。SART3 与 AR 的结合依赖于 SART3 NR 框,去除 NR 框可消除 SART3 对 AR 报告基因活性的抑制。AR阳性人前列腺癌细胞系LNCaP中组成型SART3表达的敲低显着增强了雄激素诱导的AR转录活性。SART3过表达阻断PSA的表达(KLK3;176820),LNCaP细胞中的AR靶基因。SART3 通过阻止 AR 与 AR 靶基因中雄激素反应元件之间的复合物形成来抑制 AR 转录活性。

De Troyer等人(2020)发现人类LASTR,一种应激诱导的长链非编码RNA(lncRNA),在剪接体循环过程中通过与SART3相互作用并控制其与U4和U6 snRNP的关联来调节剪接效率。人类癌细胞中 LASTR 的缺失导致了几个必需基因中内含子的保留,这与它们的下调相对应。

▼ 测绘

通过对人类/啮齿动物杂交组的PCR,Nagase等人(1995)将SART3基因定位到染色体12。Zhang等人(2005)通过基因组序列分析将SART3基因定位到染色体12q24.1。

Harada et al.(2000)将小鼠 Sart3 基因定位到与人类染色体 12q23-q24 具有同线性同源性的染色体 5 区域。

▼ 分子遗传学

有关 SART3 基因变异与汗孔角化症之间可能关联的讨论,请参见 611684.0001(POROK1;175800)。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 重新分类 - 意义未知的变体

SART3、VAL591MET

这种变体以前的标题为 POROKERATOSIS, DISSEMINATED SUPERFICIAL ACTINIC, 1(见 175900),已被重新分类,因为其对该疾病的贡献尚未得到证实。

中国6代播散性浅表光化性汗孔角化症家族的17名成员(POROK3,DSAP1;175900),Zhang et al.(2005)鉴定了SART3基因中的1771G-A转变,导致val591-to-met(V591M)取代。在表型不确定的 7 个家庭成员中,有 2 个也发现了这种突变,可能是因为他们年龄太小,无法出现 DSAP1。在 12 名未受影响的家庭成员、5 名配偶或 192 名无关个人中未发现该突变。未进行功能研究。张等人(2005)得出结论,SART3是DSAP的候选基因,可能参与该疾病的发病机制。

Frank等人(2007)对Zhang及其同事关于几种基因突变作为DSAP原因的报告的有效性和解释提出了质疑。张(2007)捍卫了他们工作的有效性。

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