基底细胞癌,易感性,3; BCC3

细胞遗传学定位:5p15.33 基因组坐标(GRCh38):5:1-4,400,000

有关基底细胞癌的一般表型描述和遗传异质性的讨论,请参见 BCC1(605462)。

▼ 测绘

Rafnar等人(2009)在对基底细胞癌进行全基因组扫描后发现染色体5p15.33上的rs401681满足全基因组显着性阈值(OR = 1.25, p = 3.7) × 10(-12))。基底细胞癌研究包括 2,565 名患者和 29,405 名对照者。然后,他们在超过 30,000 个癌症病例和 45,000 个对照中测试了 rs401681 与另外 16 种癌症类型的关联,发现与肺癌的关联(参见 LNCR3, 612571),与膀胱癌、前列腺癌和宫颈癌的关联较弱。然而,rs401681 似乎具有针对皮肤黑色素瘤的保护作用(OR = 0.88, p = 8.0 x 10(-4))。值得注意的是,大多数癌症类型的风险与环境因素密切相关。对该区域的调查发现了 rs2736098,它与某些癌症类型有更强的关联。然而,这两种变体都无法完全解释另一种变体的关联。SNP rs2736098对应于端粒酶逆转录酶蛋白(TERT;)中的A305A等位基因。187270),rs401681位于CLPTM1L基因(612585)的内含子中。

Stacey et al.(2009)在来自冰岛、东欧、美洲和西班牙的3,468例病例和38,107例对照中证实了rs401681的C等位基因与BCC的关联(优势比 = 1.20, P = 4.8 x 10(-9)) )。他们发现,BCC 的风险等位基因对 3,843 例欧洲血统病例和 41,963 名对照者具有预防皮肤黑色素瘤的保护作用(比值比 = 0.86,P = 5.0 x 10(-8))。

Tags: none