类似 SLIT 和 NTRK 的家族,成员 3;SLITRK3

KIAA0848

HGNC 批准的基因符号:SLITRK3

细胞遗传学定位:3q26.1 基因组坐标(GRCh38):3:165,186,720-165,197,109(来自 NCBI)

▼ 说明

SLITRK家族的成员,如SLITRK3,是具有2个N端富含亮氨酸重复序列(LRR)结构域的整合膜蛋白,与SLIT蛋白相似(参见SLIT1;603742)。大多数 SLITRK,包括 SLITRK3,也具有与神经营养蛋白受体具有同源性的 C 端区域(参见 NTRK1;191315)。SLITRK 主要在神经组织中表达并具有神经突调节活性(Aruga et al., 2003)。

▼ 克隆与表达

通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1998)克隆了 SLITRK3,他们将其命名为 KIAA0848。推导的蛋白质含有977个氨基酸。RT-PCR ELISA 检测到脑和肝脏中高表达,肺和卵巢中中等表达,所有其他检查组织中弱表达。

Aruga and Mikoshiba(2003)克隆了几个小鼠Slitrk cDNA,包括Slitrk3。推导的 Slitrk3 蛋白包含一个 N 末端信号肽,随后是 2 个 LRR 结构域、一个跨膜结构域和一个具有推定酪氨酸磷酸化位点的细胞质结构域。每个 LRR 结构域的两侧都是富含半胱氨酸的区域。发育中老鼠大脑的原位杂交检测到广泛的 Slitrk3 表达。

通过数据库分析,Aruga et al.(2003)鉴定出了人类SLITRK3。推导的 977 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 109 kD。与小鼠Slitrk3同源性超过95%,具有相同的蛋白质结构。Northern blot分析检测到5.2 kb的SLITRK3转录本主要存在于成人和胎儿神经组织中,其中在成人大脑皮层中表达最高。

▼ 基因功能

Aruga and Mikoshiba(2003)通过在小鼠嗜铬细胞瘤和神经母细胞瘤细胞系中过度表达,发现小鼠Slitrk3抑制神经突生长。

▼ 基因结构

Aruga等人(2003)确定SLITRK3基因含有2个外显子。外显子 1 是非编码的。

▼ 测绘

Nagase等(1998)利用放射杂交分析将SLITRK3基因定位到染色体3。Aruga等(2003)通过基因组序列分析将SLITRK3基因定位到染色体3q26。他们将小鼠 Slitrk3 基因定位到染色体 3E2 的一个区域,该区域与人类染色体 3q26 具有同线性。

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