类似 SLIT 和 NTRK 的家庭，成员 2；SLITRK2

染色体 X 开放解读码组 2; CXORF2
染色体 X 开放解读码组 1; CXORF1
跨膜蛋白 257；TMEM257
KIAA1854

HGNC Approved Gene Symbol: SLITRK2

HGNC 批准的基因符号：SLITRK2

细胞遗传学定位：Xq27.3 基因组坐标（GRCh38）：X:145,817,829-145,829,856（来自 NCBI）

▼ 说明

SLITRK 家族的成员，如 SLITRK2，是具有 2 个 N 端富含亮氨酸重复序列（LRR）结构域的整合膜蛋白，与 SLIT 蛋白相似（参见 SLIT1；603742）。大多数 SLITRK，包括 SLITRK2，也具有与神经营养素受体具有同源性的 C 端区域（参见 NTRK1；191315）。SLITRK 主要在神经组织中表达并具有神经突调节活性（Aruga et al., 2003）。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人（2001）通过对从大小分级的胎脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序，克隆了 SLITRK2，并将其命名为 KIAA1854。推导的蛋白质含有572个氨基酸。RT-PCR ELISA 检测到成人和胎儿大脑、成人脊髓以及所有检查的特定大脑区域中的中间表达。在非神经组织中几乎没有检测到表达。

Aruga and Mikoshiba（2003）克隆了几个小鼠Slitrk cDNA，包括Slitrk2。推导的 Slitrk2 蛋白包含一个 N 末端信号肽，随后是 2 个 LRR 结构域、一个跨膜结构域和一个具有 4 个假定酪氨酸磷酸化位点的细胞质结构域。每个 LRR 结构域的两侧都是富含半胱氨酸的区域。对几个小鼠组织的 Northern 印迹分析仅在大脑中检测到高 Slitrk2 表达。发育小鼠大脑原位杂交显示Slitrk2广泛表达，在脑室层（特别是脑室侧）、脑室下区、皮质板、海马锥体层、皮下神经上皮、丘脑、下丘脑和脊髓中表达显着。在大鼠嗜铬细胞瘤细胞系中，Slitrk2 定位于跨高尔基体网络和细胞外周。

通过数据库分析，Aruga等人（2003）鉴定出了人类SLITRK2。推导的 845 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 95.4 kD。与小鼠Slitrk2同源性超过95%，具有相同的蛋白质结构。Northern blot分析检测到5.1和4.1 kb的SLITRK2转录本主要存在于成人和胎儿神经组织中。在成人大脑皮层和胎儿全脑中也检测到了约 8.4 kb 的小转录本。SLITRK2 表达最高的是成人大脑皮层。

▼ 基因功能

Aruga and Mikoshiba（2003）通过在小鼠嗜铬细胞瘤和神经母细胞瘤细胞系中过度表达，发现小鼠Slitrk2抑制神经突生长，包括cAMP诱导的生长。突变分析将抑制活性定位于 Slitrk2 的 C 端胞内结构域。缺乏该结构域的 Slitrk2 会诱导神经突生长，而分离的细胞内结构域会抑制神经突发生，类似于完整的 Slitrk2 蛋白。

▼ 基因结构

Aruga等人（2003）确定SLITRK2基因含有2个外显子。外显子 1 是非编码的。

▼ 测绘

Aruga等人（2003）通过基因组序列分析，将SLITRK2基因定位到染色体Xq27的一个区域，该区域也包含SLITRK4基因（300562）。SLITRK 基因之间的插入序列约为 2 Mb。Aruga et al.（2003）将小鼠Slitrk2基因定位到染色体XA5的一个区域，该区域与人类染色体Xq27具有同源性。

▼ 历史

Redolfi et al.（1998）利用基于PCR的方法发现大脑EST源自染色体Xq27上的一个基因。Redolfi et al.（1998）获得了该基因的完整序列，命名为 TMEM257 或 CXORF1，其编码推导的 111 个氨基酸的蛋白质，推定的蛋白激酶 C 磷酸化位点位于氨基酸 77 至 79 和 96 至 98。 Northern blot 分析在大脑和 G361 黑色素瘤细胞系中检测到 1.7 和 2.5 kb 的 mRNA 转录本。原位杂交显示CXORF1在海马各亚区均有表达，其中齿状回和CA3区表达量最高。锥体神经元表达高水平的 CXORF1 mRNA，神经胶质细胞表达中等水平。动物园印迹分析显示 CXORF1 在灵长类动物、牛和马中保守。通过动物园印迹或 PCR 未在小鼠、鸡或大鼠中检测到 CXORF1。Redolfi et al.（1998）确定CXORF1是无内含子的并且以单拷贝形式存在于人类基因组中。序列分析将 CXORF1 基因定位到 DXS369 和 DXS181 之间的染色体 Xq27。然而，后来的分析表明，TMEM257/CXORF1代表的是SLITRK2基因3-prime UTR中的一个ORF，而不是一个独特的基因（Scott, 2017）。