高机动性组框2;HMGB2

高迁移率组蛋白 2;HMG2
染色体蛋白、非组蛋白、HMG2
非组蛋白染色体蛋白 HMG2

HGNC 批准的基因符号:HMGB2

细胞遗传学定位:4q34.1 基因组坐标(GRCh38):4:173,331,376-173,334,358(来自 NCBI)

▼ 说明

高迁移率族(HMG)蛋白定位于高等真核生物的细胞核,存在于3个家族中,其中1个家族包括HMG1(163905)和HMG2。这些蛋白质包括参与 DNA 结合的所谓 HMG 框。HMG1 和 HMG2 蛋白均与单链 DNA 结合,解开双链 DNA,并增加转录(Wanschura 等人总结,1996)。

▼ 克隆与表达

Shirakawa和Yoshida(1992)通过用编码染色体蛋白HMG2的猪胸腺cDNA筛选人类基因组文库,孤立出包含编码该蛋白的完整基因的片段。从 HMG2 外显子预测的 mRNA 长度为 1,125 bp。人HMG2蛋白的一级结构由208个氨基酸残基组成,与猪Hgm2的一级结构仅2个氨基酸不同;一张被调换,另一张丢失。

▼ 基因功能

RNA 聚合酶 II(参见 180660)的体内转录发生在染色质环境中。Guermah 等人(2006)发现,纯化的、重构的 RNA 聚合酶 II 系统足以在 DNA 模板上进行激活剂依赖性转录,但无法转录染色质模板,即使在纯化程度较低的检测系统中存在影响转录的因素时也是如此。Guermah等人(2006)利用互补和HeLa细胞核提取物分级分离方案,鉴定并纯化了一种活性,命名为CTEA(染色质转录使能活性),它允许通过染色质模板以激活子和p300的方式进行转录(EP300;602700)/乙酰辅酶A依赖性。CTEA 主要作用于延伸步骤,使 RNA 聚合酶 II 机器能够通过几个连续定位的核小体有效转录。Guermah et al.(2006)鉴定出CTEA的主要功能成分为转录延伸因子SII(TCEA1;601425)。SII 对于有效的转录延伸至关重要,其在此步骤的功能依赖于 p300 依赖性乙酰化。HMGB2 增强了这些协同转录延伸活性。

Yanai et al.(2009)利用pull-down实验发现,小鼠HMGB蛋白与所有免疫原性核酸结合,亲和力和免疫原性之间存在相关性。Hmgb1 -/- 和 Hmgb2 -/- 小鼠细胞在 I 型干扰素和通过 DNA 或 RNA 靶向激活胞质核酸感应受体诱导炎症细胞因子方面存在缺陷。Hmgb1、Hmgb2 和 Hmgb3(300193)表达被小干扰 RNA 抑制的 小鼠细胞,转录因子 Irf3(603734)和 Nfkb(见 164011)的激活也受损。HMGBs的缺乏还导致Toll样受体3(Tlr3;)的激活较差。603029)、Tlr7(300365)和Tlr9(605474)由它们的同源核酸(分别是dsRNA、ssRNA和低甲基化DNA)组成。Yanai et al.(2009)得出结论,核酸感应受体的选择性激活取决于HMGB对核酸的更混杂的感应,并且可能对免疫疾病的治疗具有影响。

▼ 基因结构

Shirakawa和Yoshida(1992)确定HMG2从转录起始位点到转录结束长度为2,665 bp,包含5个外显子。存在规范的 5 素调控基序 CCAAT,而该基因中不存在 TATA 元件。

▼ 测绘

Wanschura等(1996)通过荧光原位杂交将HMG2基因定位到染色体4q31。

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