载脂蛋白 L-IV;APOL4

APOL-IV

HGNC 批准的基因符号:APOL4

细胞遗传学定位:22q12.3 基因组坐标(GRCh38):22:36,189,128-36,204,833(来自 NCBI)

▼ 说明

载脂蛋白L(APOL)蛋白属于高密度脂蛋白家族,在胆固醇转运中发挥核心作用。细胞膜的胆固醇含量在细胞过程中很重要,例如调节成人大脑和神经发育过程中的基因转录和信号转导。6 个 APOL 基因聚集在染色体 22q12.3 上。

▼ 克隆与表达

Duchateau et al.(2001)通过EST和基因组序列分析,在染色体22上鉴定出了几个与APOL1(603743)具有密切同源性的APOL基因,其中包括APOL4。他们从胎盘 cDNA 文库中克隆了 APOL4,并鉴定了因包含外显子 3 而产生的剪接变体。预测的蛋白质的分子量为 38.8 和 39.2 kD。

Page等(2001)通过半定量RT-PCR检测到APOL4普遍表达,他们将其称为APOL3,在前列腺和胎盘中表达最高,在脑、心脏、胎肝、胰腺和睾丸中表达较弱。

▼ 基因功能

Mimmack等人(2002)在对精神分裂症(181500)和对照大脑前额叶皮层基因表达的微阵列分析中发现APOL1、APOL2(607252)和APOL4基因显着上调。

▼ 基因结构

Duchateau et al.(2001)确定APOL4基因含有6个外显子。APOL1、APOL2、APOL3(607253)、APOL4基因启动子区至少有1个SP1(189906)位点,多个AP1(165160)和AP4(600743)位点,至少1个GC box,多个锌指-结合位点,以及至少1个甾醇调节元件结合蛋白(见184756)位点。每个包含至少 2 个保守的起始序列。最常用的启动子区域不含 TATA,具有多个转录起始位点。APOL4 的 3 素非翻译区还包含 4 个聚腺苷酸化信号。

Monajemi et al.(2002)注意到内含子序列的同源性,得出结论:APOL1、APOL2、APOL3和APOL4基因簇是串联基因复制的结果,而APOL5(607255)和APOL6(607256)的相关性更远。

▼ 测绘

Duchateau等(2001)通过基因组序列分析,将APOL4基因定位到染色体22q12.1-q13.1。它位于包含 APOL1、APOL2 和 APOL3 的集群中,跨度为 127 kb。APOL1 与其他 3 个基因的方向相反。Page et al.(2001)发现 APOL 簇包含 6 个基因,跨度 619 kb。

Mimmack 等人(2002)在图 3 中绘制了染色体 22q12.3 上 APOL 基因家族的基因组结构。染色体22q11上的COMT基因(116790)距APOL6基因15.2 Mb,位于APOL基因簇的端粒末端。APOL1 基因位于簇的端粒末端。

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