类似 SLIT 和 NTRK 的家庭,成员 4; SLITRK4
HGNC 批准的基因符号:SLITRK4
细胞遗传学定位:Xq27.3 基因组坐标(GRCh38):X:143,622,790-143,636,101(来自 NCBI)
▼ 说明
SLITRK 家族的成员,如 SLITRK4,是具有 2 个 N 端富含亮氨酸重复序列(LRR)结构域的整合膜蛋白,与 SLIT 蛋白相似(参见 SLIT1;603742)。大多数 SLITRK,包括 SLITRK4,也具有与神经营养素受体同源的 C 端区域(参见 NTRK1;191315)。SLITRK 主要在神经组织中表达并具有神经突调节活性(Aruga et al., 2003)。
▼ 克隆与表达
Aruga and Mikoshiba(2003)克隆了几个小鼠Slitrk cDNA,包括Slitrk4。推导的 Slitrk4 蛋白包含一个 N 末端信号肽,随后是 2 个 LRR 结构域、一个跨膜结构域和一个具有推定酪氨酸磷酸化位点的细胞质结构域。每个 LRR 结构域的两侧都是富含半胱氨酸的区域。对几个小鼠组织的 Northern 印迹分析仅在大脑中检测到高 Slitrk4 表达。发育小鼠大脑的原位杂交显示Slitrk4广泛表达,在室下区、皮质板、丘脑、下丘脑和海马CA3区有显着表达。
通过数据库分析,Aruga et al.(2003)鉴定出了人类SLITRK4。推导的 837 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 96.3 kD。与小鼠Slitrk4同源性超过95%,具有相同的蛋白质结构。Northern blot分析检测到8.7和6.9 kb的SLITRK4转录本主要存在于成人和胎儿神经组织中,其中在成人大脑皮层中表达最高。
▼ 基因功能
Aruga and Mikoshiba(2003)通过在小鼠嗜铬细胞瘤和神经母细胞瘤细胞系中过度表达,发现小鼠Slitrk4微弱地抑制神经突生长。
▼ 基因结构
Aruga等人(2003)确定SLITRK4基因含有2个外显子。外显子 1 是非编码的。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Aruga等人(2003)将SLITRK4基因定位到染色体Xq27的一个区域,该区域也包含SLITRK2基因(300561)。SLITRK 基因之间的插入序列约为 2 Mb。Aruga et al.(2003)将小鼠Slitrk4基因定位到染色体XA5的一个区域,该区域与人类染色体Xq27具有同源性。