核 RNA 输出因子 2; NXF2

HGNC 批准基因符号:NXF2

细胞遗传学定位:Xq22.1 基因组坐标(GRCh38):X:102,247,167-102,326,722(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

mRNA从细胞核输出涉及多种蛋白质,包括核孔蛋白、RNA结合蛋白、RNA解旋酶(DDX19;605812),以及核孔复合体相关蛋白,如NXF1(602647)和RAE1(603343)。Herold等(2000)通过检索EST数据库中NXF1的同源物并通过RT-PCR分析,获得了编码NXF2、NXF3(300316)、NXF4(300318)和NXF5(300319)的cDNA。推导的 626 个氨基酸的 NXF2 蛋白具有 NXF1 的保守结构域结构,包括一个非典型的 RNP 型 RNA 结合结构域(RBD)、4 个富含亮氨酸的重复序列(LRR)、一个核转运因子 2(NTF2;605813)样结构域,允许与NTF2相关输出蛋白-1(NXT1;605811),以及介导与核孔蛋白相互作用的泛素相关结构域。荧光显微镜显示 NXF2 在核质和核膜中表达,但在核仁中被排除。

Wang et al.(2001)通过从精原细胞cDNA中扣除睾丸体组织cDNA,并进行数据库检索和筛选睾丸cDNA文库,也鉴定出了NXF2。

▼ 基因功能

Herold等人(2000)的结合分析表明NXF1、NXF2和NXF3与E1BAP5(605800)以及NXT1和NXT2(300320)相互作用。NXF1 和 NXF2 的 RBD(而非 NXF3 的 RBD)被发现与 RNA 结合。然而,只有 NXF1 可以促进由猿猴 D 型逆转录病毒的组成型转运元件介导的 RNA 输出。NXF1和NXF2(但NXF3除外)通过其C端NWD环可以与核孔蛋白CAN(NUP214; 114350)、NUP153(603948)、NUP62(605815)。只有NXF1可以与NUP98(601021)结合。CAT报告基因和蛋白质印迹分析显示,NXF1或NXF2而非NXF3的共表达与NXT1或NXT2激活CAT表达,表明在这些条件下NXF2可以刺激RNA输出。导出活动需要 LRR 和类似 NTF2 的域。

FMRP(FMR1; 309550)是一种核质穿梭RNA结合蛋白,参与mRNA转运和转录控制。张等人(2007)利用免疫沉淀分析和实时定量RT-PCR表明,培养的小鼠神经元细胞中含有Nxf1 mRNA的核糖核蛋白颗粒中存在Fmrp和Nxf2。Nxf2 的表达导致 Nxf1 mRNA 不稳定,当小干扰 RNA 减少 Fmrp 表达时,这种效应被消除。张等人(2007)得出结论,FMRP 和 NXF2 共同破坏 NXF1 mRNA 的稳定性。

▼ 基因结构

Herold et al.(2000)确定NXF2基因至少包含21个外显子。

▼ 测绘

Herold等人(2000)利用基因组序列分析将NXF2基因定位到X染色体。Wang等(2001)通过基因组序列和放射杂交分析证实NXF2基因定位于X染色体。

Chen et al.(2006)确定染色体Xq22.1上存在2个NXF2基因的反向重复序列。

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