DXZ4 相关非编码转录 2,远端; DANT2
HGNC 批准的基因符号:DANT2
细胞遗传学定位:Xq23 基因组坐标(GRCh38):X:115,840,396-115,969,111(来自 NCBI)
▼ 说明
DANT2是一种长链非编码RNA(lncRNA),起源于染色体X的DXZ4大卫星重复区域(Figueroa et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
染色体 X 中的 DXZ4 大卫星重复序列由富含 GC 的串联重复序列组成,每个重复序列包含 12 至 120 个单位,每个单位约 3 kb。通过分析源自 DXZ4 大卫星重复区域的 EST,Figueroa 等人(2015)鉴定了 2 个 lncRNA,DANT1(301001)和 DANT2,它们从相对链上重复阵列侧翼的启动子相互转录。Figueroa等人(2015)还鉴定了DANT1和DANT2的剪接变体,并且至少有1个DANT2转录物与相反链上的DANT1重叠。DANT2 转录本仅共享外显子 1;没有转录本显示出任何编码概率,并且大多数没有聚腺苷酸化。在人类胚胎干细胞(ESC)和多种人类细胞系中检测到高 DANT2 表达。RT-PCR 在小脑、整个成人大脑和胎儿大脑中检测到 DANT2 的长剪接变体,在一些体细胞组织中表达较弱。其他变体表现出组织特异性表达。RNA FISH 显示雄性 ESC 中 DXZ4、DANT1 和 DANT2 以及雌性 ESC 中活性 X 等位基因的空间差异表达。3 个转录本看起来彼此接近,但很少重叠。
▼ 基因结构
Figueroa et al.(2015)确定DANT2基因至少有5个外显子,跨度超过100 kb。
▼ 测绘
Figueroa et al.(2015)将DANT2基因定位到染色体Xq23。