肽基精氨酸脱亚胺酶,II 型; PADI2
HGNC 批准基因符号:PADI2
细胞遗传学定位:1p36.13 基因组坐标(GRCh38):1:17,066,761-17,119,451(来自 NCBI)
▼ 说明
肽基精氨酸脱亚胺酶(PADs;EC 3.5.3.15),例如 PADI2,是一类后修饰酶,可在钙离子存在的情况下将肽中的精氨酸残基转化为瓜氨酸残基。
▼ 克隆与表达
Watanabe 和 Senshu(1989)克隆了大鼠 Padi2。Northern印迹分析检测到大鼠骨骼肌、脊髓、大脑、小脑和颌下腺中的表达。在肝脏和肾脏中未检测到表达。
利用大鼠PADI2筛选培养的皮肤鳞状细胞癌cDNA文库,随后通过5-prime RACE,Ishigami et al.(2002)克隆了PADI2。推导的 665 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 75 kD。它与大鼠和小鼠Padi2 具有93% 的氨基酸同一性。对人体皮肤冷冻切片的免疫组织化学分析显示,PADI2 存在于所有活表皮层(包括基底层、棘层和颗粒层)的角质形成细胞的细胞质内,但在角质层中不表达。
▼ 基因功能
Ishigami等人(2002)通过测定细菌培养物中表达的重组PADI2的活性,证明PADI2具有针对合成底物的肽基精氨酸脱亚氨酶活性。
▼ 基因结构
Ishigami et al.(2002)确定PADI2基因包含16个外显子,跨度超过52.6 kb。
▼ 测绘
Ishigami et al.(2002)通过基因组序列分析,将PADI2基因定位到染色体1p35.21-p35.2
Suzuki et al.(2003)在寻找与类风湿性关节炎易感性相关位点的过程中(180300),从序列数据中发现了4个肽基精氨酸脱亚氨酶位点,PADI1(607934)、-2、-3(606755)、和-4(605347),位于1p36。