跨膜通道样蛋白 7; TMC7

HGNC 批准基因符号:TMC7

细胞遗传学定位:16p12.3 基因组坐标(GRCh38):16:18,983,934-19,063,942(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过在基因组和EST数据库中搜索与小鼠和人类TMC1(606706)和TMC2(606707)相似的序列,Kurima et al.(2003)鉴定出了TMC7。推导的人和小鼠的723-和726-氨基酸蛋白分别具有91%的序列同一性。预计两者都驻留在质膜中,具有 9 或 10 个潜在的跨膜结构域,以及大约 120 个氨基酸的 TMC 结构域。TMC7 预计具有细胞外 N 末端和细胞质 C 末端。TMC7 蛋白还具有许多潜在的酰胺化、糖基化、肉豆蔻酰化和磷酸化位点。PCR 检测胎盘、前列腺和睾丸 cDNA 文库中的小鼠和人 TMC7。

Keresztes et al.(2003)克隆了小鼠Tmc7。推导的 726 个氨基酸的蛋白质具有 10 个可能的跨膜结构域、第 6 个跨膜结构域之前的 TMC 基序以及预计位于细胞内的 N 和 C 末端。RT-PCR检测到所有17个小鼠组织中存在不同的Tmc7表达,其中在皮质、小脑、膀胱和睾丸中表达最高,在耳蜗、唾液腺和胸腺中表达最低。

▼ 进化

Kurima等(2003)通过对小鼠和人类TMC基因的系统发育分析,确定TMC7与TMC4(617181)、TMC5(617197)、TMC6(605828)和TMC8(605829)属于不同的TMC亚家族。TMC5 和 TMC7 在染色体 16 上彼此定位在 400 kb 范围内,而 TMC6 和 TMC8 在染色体 17 上定位在彼此 4 kb 范围内。4 个直系同源 小鼠基因之间存在类似的关系。TMC5 和 TMC6 之间以及 TMC7 和 TMC8 之间的序列相似性表明,4 个旁系同源物可能源自 2 个串联排列的祖先同源物的重复。

▼ 测绘

Kurima等(2003)通过基因组序列分析,将TMC7基因定位到染色体16p12.3。他们将小鼠 Tmc5 基因定位到染色体 7。

Keresztes et al.(2003)将TMC7基因定位到染色体16p12.3。

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