高度加速区域基因1A; HAR1A

HAR1F

HGNC 批准的基因符号：HAR1A

细胞遗传学定位：20q13.33 基因组坐标（GRCh38）：20:63,101,292-63,104,386（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Pollard等人（2006）利用表达序列标签（EST）分析将HAR1A基因鉴定为HAR1F，它是一对包含“人类加速区”HAR1的重叠分歧转录基因之一（另见HAR1B，610557） 。Pollard et al.（2006）发现HAR1A RNA的蛋白质编码潜力很差或不存在，但它形成了稳定的RNA结构。

▼ 基因结构

Pollard et al.（2006）确定HAR1A基因含有2个外显子。

▼ 测绘

Pollard等（2006）通过基因组序列分析，将HAR1A基因定位到染色体20q13.33。

▼ 进化

Pollard 等人（2006）设计了人类基因组中显示出显着进化加速的区域的排名。这些“人类加速区域”中最引人注目的是 HAR1。Pollard et al.（2006）发现，自人类-黑猩猩祖先以来，118 bp的HAR1区域包含18个替换，但在黑猩猩和鸡之间只有2个碱基发生了变化。对 4 种灵长类动物的重新测序进一步证实，所有 18 个替换很可能都发生在人类谱系中。24 人多样性小组的重新测序表明，所有 18 个替换在人群中都是固定的。Pollard等人（2006）基于进一步的实验得出结论，HAR1的变化明显发生在人类谱系上，但可能发生在超过100万年前。

▼ 基因功能

Pollard等（2006）利用人胚胎脑切片的RNA原位杂交技术，在妊娠7周和9周时检测到HAR1A在背侧端脑中表达，但在前脑的其他部分没有表达。在早期发育的皮层中，HAR1F 在靠近边缘区软脑膜表面的细胞子集中选择性表达，表明它在 Cajal-Retzius 神经元中表达。它与这些神经元的特异性标记物水晶蛋白（600514）共同检测到。HAR1A 在表达 GABA 的中间神经元中不表达。HAR1 表达维持到至少 17 至 19 周妊娠。HAR1A 还被发现在上皮质板中表达，可能对应于完成径向迁移的神经元。在妊娠后期（24周），Cajal-Retzius细胞中不再检测到HAR1A的表达。妊娠17至24周时，在海马原基、齿状回、发育中的小脑皮质和一些后脑核（例如橄榄复合体）中观察到HAR1A表达。成人脑切片的原位杂交显示，HAR1A 的表达在小脑中最高，并且在包括皮质、海马、丘脑和下丘脑在内的前脑结构中也很突出。通过实时定量 PCR 也检测到卵巢和睾丸中的表达。