死框解旋酶 19B;DDX19B

死亡/H框19;DDX19
DBP5,酵母,同源物; DBP5

HGNC 批准的基因符号:DDX19B

细胞遗传学定位:16q22.1 基因组坐标(GRCh38):16:70,289,767-70,335,305(​​来自 NCBI)

▼ 说明

DEAD box蛋白(如EIF4A1;602641)是RNA依赖性核苷酸三磷酸酶RNA解旋酶蛋白家族的成员。Dbp5 是一种 DEAD box 蛋白,在酵母细胞核 mRNA 输出中发挥重要作用(Schmitt et al., 1999)。

▼ 克隆与表达

Schmitt等(1999)通过EST数据库检索和RT-PCR获得了编码DDX19(Dbp5的人类同源物)的cDNA。推导的 479 个氨基酸的蛋白质分别与小鼠和酵母序列有 94% 和 46% 的同一性。蛋白质印迹分析显示重组蛋白和天然蛋白具有相同的分子量,约为 56 kD。功能分析表明,DDX19 表现出 RNA 依赖性 ATP 酶和 ATP 依赖性 RNA 解旋活性。荧光显微镜显示 DDX19 的细胞质表达,其中一部分位于核边缘。串联亲和纯化分析确定DDX19与核孔蛋白CAN/Nup159p(NUP214;NUP214;114350)。免疫电镜显示DDX19定位于核孔复合体(NPC)的细胞质原纤维。突变分析确定 DEAD 框基序中的 glu243 对于 RNA 依赖性 ATP 酶和解旋活性以及 mRNA 输出至关重要。Schmitt et al.(1999)得出结论,DDX19被招募到NPC的细胞质原纤维中,在那里它参与mRNA从细胞核的输出。

▼ 基因功能

Gross et al.(2007)以酿酒酵母为模式生物,鉴定出DEAD box RNA解旋酶和mRNA输出因子Dbp5在转录终止中发挥作用。Dbp5 与释放因子 Erf1(600285)和 Erf3(参见 139259)以及聚腺苷酸结合蛋白 Pab1(604679)存在遗传相互作用。通过 eRF1 专门检测到物理相互作用。此外,Gross等人(2007)表明,Dbp5的解旋酶活性是有效终止密码子识别所必需的,完整的Dbp5对于将eRF3招募到终止复合物中至关重要。因此,Dbp5 控制 eRF3-eRF1 相互作用,从而控制 eRF3 介导的下游事件。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将DDX19基因定位到染色体16(WI-16772)。

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