核帽结合蛋白 3;NCBP3
染色体 17 开放解读码组 85; C17ORF85
HGNC 批准的基因符号:NCBP3
细胞遗传学定位:17p13.2 基因组坐标(GRCh38):17:3,802,158-3,846,246(来自 NCBI)
▼ 说明
聚合酶 II 转录 DNA 会产生带有 N7-甲基化鸟嘌呤(m7G)帽结构标记的 RNA,该帽结构通过共转录方式附着在 RNA 的 5 引物末端,并作为下游处理的信号。NCBP3 与 NCBP1(600469)形成核帽结合复合物,协调下游 RNA 加工(Gebhardt et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Gebhardt et al.(2015)利用亲和纯化分离出与加帽但不与未加帽的RNA结合的蛋白质,然后进行质谱分析,鉴定出NCBP3。推导的 620 个氨基酸的蛋白质具有 RNA 识别基序(RRM)折叠,在其 N 端半部包含 RNA 结合基序(WLDD),随后是富含谷氨酰胺的非结构化 C 端结构域,其中包含 2 个核定位信号。数据库分析表明NCBP3在人体组织中广泛表达。主要在转染的 HeLa 细胞的细胞核中检测到荧光标记的 NCBP3。NCBP3 的直系同源物存在于多种物种中,但似乎在果蝇和酿酒酵母中丢失。
▼ 基因功能
Gebhardt等人(2015)使用固定化m7GTP作为诱饵,证实NCBP3与人和小鼠巨噬细胞系中的加帽RNA相互作用。在大肠杆菌中表达的重组 NCBP3 以帽子依赖性方式沉淀 RNA。结构域分析表明,核心 RRM 结构域参与结合 m7GTP,WLDD 基序的突变消除了 NCBP3 与加帽 RNA 或 m7GTP 的相互作用。NCBP3 通过其 C 端结构域与 NCBP1 相互作用。对共沉淀 HeLa 细胞蛋白的质谱分析表明,NCBP3 优先与参与 mRNA 加工和输出的蛋白质相互作用,而 NCBP3 旁系同源物 NCBP2(605133)优先与参与小核 RNA(snRNA)输出的蛋白质相互作用。RNA免疫沉淀显示NCBP2和NCBP3均与加帽mRNA相互作用,但snRNA、长基因间非编码RNA和反义RNA优先结合NCBP2。单独敲低 NCBP3 或 NCBP2 对 HeLa 细胞和 NIH3T3 小鼠成纤维细胞的生长或 mRNA 核积累几乎没有影响。然而,NCBP2 和 NCBP3 的敲低会降低细胞生长,减少 NCBP1 与 m7GTP 的关联,并导致 mRNA 的核积累。HeLa 细胞中 NCPB3 的敲低(而非 NCBP2)会增加受感染的水泡性口炎病毒、塞姆利基森林病毒和脑心肌炎病毒的细胞质复制。Gebhardt et al.(2015)的结论是,NCBP2和NCBP3在稳态条件下可以相互补偿,但NCBP3是限制病毒感染程度所特别需要的。
▼ 测绘
Hartz(2015)根据NCBP3序列(GenBank AJ277841)与基因组序列(GRCh38)的比对,将NCBP3基因定位到染色体17p13.2。