蛋白质精氨酸甲基转移酶 6; PRMT6
HGNC 批准基因符号:PRMT6
细胞遗传学定位:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:107,056,674-107,059,294(来自 NCBI)
▼ 说明
蛋白质精氨酸 N-甲基转移酶,例如 PRMT6,催化甲基从 S-腺苷-L-甲硫氨酸顺序转移到蛋白质内精氨酸残基的侧链氮上,形成甲基化精氨酸衍生物和 S-腺苷-L-高半胱氨酸。
▼ 克隆与表达
Frankel等人(2002)通过在基因组中搜索PRMT家族成员,然后对肾脏cDNA文库进行5-prime RACE,克隆了PRMT6。推导的 375 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 41.9 kD。PRMT6 包含催化核心序列,没有其他结构域。PRMT6和PRMT2(601961)的催化核心具有38%的氨基酸同一性。Northern 印迹分析检测到 2.4-和 2.6-kb 转录物的广泛表达。荧光标记的 PRMT6 的共聚焦显微镜显示转染的 HeLa 细胞中有很强的核定位。
▼ 基因功能
Frankel et al.(2002)测定了在大肠杆菌中过表达的重组PRMT6的PRMT活性。PRMT6 表现出 I 型 PRMT 活性,在富含甘氨酸和精氨酸的重组底物上形成 omega-N(G)-单甲基精氨酸和不对称 omega-N(G),N(G)-二甲基精氨酸衍生物。最初存在单甲基物质的积累,随后积累最终的二甲基精氨酸产物。底物特异性的比较表明PRMT6在功能上不同于PRMT1(602950)和PRMT4,它们也是I型PRMT。此外,PRMT6 显示出自动甲基化活性。
El-Andaloussi et al.(2006)确定人POLB(174760)与PRMT6形成复合物并被PRMT6甲基化。在体外,与未修饰的酶相比,甲基化 POLB 具有显着更高的 DNA 聚合酶活性。甲基化后 DNA 聚合酶活性的增加是由于 POLB 增强的 DNA 结合和持续合成能力。
继观察组蛋白 H3(见 602810)精氨酸-2(H3R2me2a)的不对称二甲基化与人类启动子上 H3 赖氨酸-4(H3K4me2、H3K4me3)的二甲基化和三甲基化反相关后,Guccione et al.(2007)证明:精氨酸甲基转移酶 PRMT6 在体外催化 H3R2 二甲基化,并在体内控制 H3R2me2a 的整体水平。H3 尾上 H3K4me3 的存在阻止了 PRMT6 对 H3R2 的甲基化。相反,H3R2me2a 标记阻止了 H3K4 的甲基化以及 ASH2(604782)/WDR5(609012)/MLL(159555)家族甲基转移酶复合物与 H3 尾部的结合。染色质免疫沉淀显示,H3R2me2a 分布在体内和人类基因的 3 端,无论其转录状态如何,而它选择性地局部去除活性启动子,这与 H3K4me3 的存在一致。Guccione et al.(2007)得出结论,因此,H3R2和H3K4甲基化之间的相互拮抗作用,以及MLL家族复合物与基础转录机制的关联,可能有助于转录平衡或活性启动子的H3K4三甲基化特征的局部模式在哺乳动物基因组中。
▼ 测绘
Frankel等(2002)通过基因组序列分析,将PRMT6基因定位到染色体1。
Wolf(2009)报道PRMT6基因定位于染色体1p13.3。